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目的探讨临床疗效和安全性的中药金水宝胶囊治疗亚急性甲状腺炎。方法亚急性甲状腺炎80例患者随机分为金水宝胶囊治疗组40例，对照组40例，西药芬必得。观察8w，随访3个月，停止治疗后，比较两组症状体征改善时间，疗效，疗程，安全，甲减发生率和复发率。结果治疗组为100%，有效率94%，西药对照组，两组比较有显著性差异(<0.05)。中药治疗组甲状腺肿胀疼痛，起效时间为(7.14±0.13)d和(8.90±0.59)d，对照组和西药有显著性差异(<0.05)。中药治疗组和西药对照组退热时间无显著性差异(跃0.05)。中药治疗组(37.85±0.89)d，西药组(47.33±1.35)d，两组比较有显著性差异(<0.05)。随访3个月，甲状腺功能减退的发生率是16%，中药治疗，西药组为28%；中医治疗组1例无复发，复发的2例西药组。中药治疗组未发现不良反应。结论金水宝胶囊对亚急性甲状腺炎的短疗程治疗，甲状腺功能减退的发生率和复发率低，无明显不良反应。