1979年5月，撒切尔夫人出任英国首相。从她上任第一天起，她和英国女王伊丽莎白二世的关系就受到了公众的密切关注。照理说，撒切尔夫人与女王是同辈人，且同为女性，两人应该有更多的良性互动，但事实上，两人的关系一开始并不友好。首先，两人的性情截然不同。伊丽莎白二世性情随和，不失幽默，而“铁娘子”撒切尔夫人则一向特立独行，甚至有些高冷。其次，二人的家庭背景差异巨大，造成了二人不同的处世观。伊丽莎白二世生来就是王室貴胄，撒切尔夫人则是一个杂货商的女儿，通过一路摸爬滚打、历尽艰辛才成为英国首相的，这使得撒切尔夫人心气极高，过分地看重自己的身份和力量。这都给二人的关系埋下了隐患。
　　按照规定，撒切尔夫人身为首相，每周都要觐见女王，共同探讨政事。然而，撒切尔夫人竞提出重新安排原先规定的觐见时间，甚至因为自身原因而爽约。有一次，女王邀请他们全家来王室城堡进餐和下榻，撒切尔夫人居然因为家庭原因直接拒绝了这一邀请。一些细心的民众发现，此后，撒切尔夫人和女王就很少一起在公众场合露面了。即使露面，撒切尔夫人的手下都会努力确保首相不会与女王撞衫，以免落了下风。
　　对此，英国政府的一些高级官员也表示，撒切尔夫人和女王的关系的确有点儿“微妙”。英国某当代作家也提到，女王和撒切尔夫人关系不睦。女王有时会开玩笑似的模仿撒切尔夫人说话的口音，还曾经在其他国家领导人面前称撒切尔夫人为“那个女人”。
　　1986年7月，英国第一主流大报《星期日泰晤士报》刊登了一篇重磅文章，标题十分抓人：《女王对冷漠无情的撒切尔夫人很失望》。文章声称，女王对撒切尔夫人提出的经济政策忧心忡忡，认为她激进的做法可能会引发社会动荡……这篇报道使撒切尔夫人非常不快，声称女王的做法有违英国的政治惯例，并表示这给自己带来很大压力。但对此“正面交锋”，英国王室很久以后才出面表态，认为报道不实。这起事件之后，撒切尔夫人和女王的关系降到了冰点。幸运的是，撒切尔认识到这种状况不能再持续下去了，决定亲自出面“破冰”。
　　原来，撒切尔与女王的母亲关系良好，而且他们有一个共同的爱好：品酒。于是，撒切尔常常在陪同妻子出访他国时购买一些当地的名酒，回国后再特意和妻子一起带上这些酒去拜访王太后，邀请王太后一起品酒。在大家品酒拉家常的时候，撒切尔夫人常常借机向王太后倾诉自己的苦衷，解释她的一些政策。时间长了，王太后开始对撒切尔夫人表示同情，也渐渐理解了她的一些政策。之后，王太后当起了“和事佬”，帮助撤切尔夫人和女王互相理解。撒切尔夫人和女王的关系由此得到了极大改善。
　　1990年，撒切尔夫人被迫下台。女王不计前嫌地邀请撒切尔夫人观看了一场赛马会，撒切尔夫人深受感动。2013年，撒切尔夫人因中风去世，女王还参加了撒切尔夫人的葬礼——这是女王在位期间第二次参加前首相的葬礼（女王上一次送别的是丘吉尔），可见撒切尔夫人在其心中的地位。