新分离的两株EV71病毒基因特征分析

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目的:了解安徽马鞍山市肠道病毒71型(EV71)基因型的分布状况。方法:利用逆转录半巢式PCR(RT-nPCR)的方法检测马鞍山地区40份临床诊断为手足口病患儿的血清和咽拭子标本。结果:40份标本中检测到2份阳性EV71 RNA,检出率为5%;经过测序证实2份标本均为EV71 C型。结论:马鞍山地区手足口病主要由C型EV71病毒引起;利用生物信息学软件对这2份标本的核苷酸同源性进行比较,发现C型EV71存在一定的变异。 Objective: To understand the distribution of enterovirus 71 (EV71) genotype in Ma’anshan City, Anhui Province. Methods: Serum and throat swabs from 40 clinically diagnosed hand-foot-mouth disease patients in Maanshan were detected by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-nPCR). Results: Two positive EV71 RNAs were detected in 40 samples, the detection rate was 5%. After sequencing, the two samples were EV71 C type. Conclusion: Hand-foot-mouth disease in Maanshan district is mainly caused by EV71 type C virus. By using bioinformatics software to compare the nucleotide homology of the two samples, it is found that there is some variation in C-type EV71.
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