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猪只与其生活的环境之间不仅存在物质和能量的交换，同时也存在微生物的交换，猪自身携带的微生物能够影响环境，环境中存在的微生物也不断影响猪群。猪与数量众多的微生物菌群处于一种动态的平衡状态，猪群在生活过程中不断地与环境发生相互作用，良好的畜舍环境与动物健康息息相关。当猪舍内部有害细菌数量过多或占主导地位时，则会给猪只健康造成严重危害，并对环境造成极大破坏。相反，如果猪舍内部有害微生物数量小，或以有益菌占主导，则有利于猪群的健康水平。维持良好的猪舍微生态环境对于猪群健康具有十分重要的作用。保持猪舍良好的微生态环境，需要在栏舍设计、日常管理、病畜隔离及定期补充益生菌等多个方面采取综合措施。