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近年来对珍珠层中蛋白质及蛋白质对碳酸钙结晶控制作用的研究得出珍珠层中含各种各样的功能蛋白质，不同种类动物形成的珍珠层中所含的主要蛋白质种类不同，它们各自独有自己的结构和功能，蛋白质对珍珠层中无机相的成核、结晶、形貌等的控制作用明显存在，但是，目前体外的仿生矿化实验不能复制珍珠层中无机相的形貌，这种控制作用的详细机理仍不清楚，人们对其认识还处于初步的阶段。