【摘 要】
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从NCBI中获得PPE7蛋白的编码基因序列,设计引物从H37Rv基因组中克隆出Rv0354c基因,将其转化到大肠杆菌感受态细胞DH5α中,扩大培养后测序鉴定。同时,运用ORF Finder、BLAST、Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM Server v.2.0、SignalP4.1 Server、NetPhos3.1 Server、NetAcet1.0 Serv
【机 构】
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蚌埠医学院慢性疾病免疫学基础与临床安徽省重点实验室
【基金项目】
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安徽省自然科学基金项目（1908085MH252,2008085QH405）；
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从NCBI中获得PPE7蛋白的编码基因序列,设计引物从H37Rv基因组中克隆出Rv0354c基因,将其转化到大肠杆菌感受态细胞DH5α中,扩大培养后测序鉴定。同时,运用ORF Finder、BLAST、Protparam、ProtScaleon Expasy、TMHMM Server v.2.0、SignalP4.1 Server、NetPhos3.1 Server、NetAcet1.0 Server、NetNGlyc1.0 Server、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、STRING等生物信息学分析工具对PPE7蛋白可能的相关生物学信息进行预测。结果显示,Rv0354c基因成功扩增,测序正确。基因全长426 bp,有2个开放阅读框,其编码蛋白为PPE7,由141个氨基酸组成,等电点为5.45,为疏水性蛋白,跨膜氨基酸数为0.59727,无信号肽、乙酰化位点和N-糖基化位点,有14个磷酸化位点;并且PPE7具有潜在的T、B细胞表位,与多种蛋白质存在相互作用关系,可能为抗结核疫苗的研发提供重要参考。
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