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采用RAPD标记，将33份对玉米丝黑穗病有不同抗性的普通玉米骨干自交系分为5个类群，RAPD标记划分的结果与传统的遗传系谱不完全一致，但与杂种优势利用的结果相符，生产上优良的杂交组合无一出现在类群内；18个抗病或中抗系分散于5个类群中，依据杂种优势利用的原理，可用类群内的抗病系改良类群内的感病系选育优良的抗病系。