目的了解昆明市2011~2016年新入组进行艾滋病抗病毒治疗HIV/AIDS患者合并丙型肝炎病毒感染情况及丙肝基因亚型情况。方法收集昆明市第三人民医院感染一科(2011~2016)年新入组进行抗病毒治疗HIV/AIDS患者的临床资料,分析其基线情况,同期我院检验科测序分析HCV基因分型并进一步进行整理分析。结果近5年HIV-1合并HCV占HIV-1总体感染率19.2%(687/3 571),HCV合并HIV-1感染呈逐年下降趋势(2011年27.3%、2012年24.1%、2013年18.1%、2014年17.5%、2015年14.4%),HIV/HCV共感染率及静脉吸毒患者比例均逐年下降(P=0.000)。HIV/HCV共感染322例HCV基因分型以3a(24.2%)、3b(41.7%)型为主,6a(6.2%)、1b(18.6%)、不能确定分型(9.3%),2a(0%),单纯HCV感染2 140例HCV基因分型亚型以2a(12.5%)、3a(18.5%)、3b(41.3%)为主,6a(3.2%)、1b(15.5%)、不能确定分型(9%),经卡方检验两组感染者在各基因亚型之间差异具有统计学意义(χ2=87.169,P<0.05.)。结论昆明市新入组抗病毒治疗HIV/AIDS患者合并HCV感染较为常见,昆明市HCV基因分型以3a、3b亚型为主,3a、6a、1b亚型在HIV/HCV共感染者中的感染率高于在单纯HCV感染者,而2a基因亚型在HIV/HCV感染者中暂未检出。