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根据清水河东沟铜钼矿床地质特征及矿体蚀变分带特征,研究认为清水河东沟铜钼矿床成因类型属于斑岩型铜钼矿床,其成矿围岩为中元古界小庙组变质岩,成矿原岩为浅成—超浅成云英闪长斑岩体。沿斑岩体垂直分布4个规模较大的矿体。矿体形态单一,大多产于岩体内和围岩接触带。矿体延伸稳定,品位相对富集。岩体和围岩蚀变强烈,明显受区域变质作用影响。