基于隐马尔科夫模型的基因预测算法

来源 :大连海事大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lanqishi1989

【摘要】

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为更好地从DNA序列中识别蛋白质编码区,提高计算效率,将隐马尔科夫模型与前向算法相结合,提出一种生物基因的预测算法.理论证明,该隐马尔科夫模型与经过EM算法优化后的模型具

【作者】

：

马宝山朱义胜

【机构】

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大连海事大学信息科学技术学院;

【出处】

：

大连海事大学学报

【发表日期】

：

2008年04期

【关键词】

：

基因识别隐马尔科夫模型前向算法 EM算法

【基金项目】

：

重大基础研究前期研究专项资助项目(2005CCA02200);国家自然科学基金资助项目(60671061)

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为更好地从DNA序列中识别蛋白质编码区,提高计算效率,将隐马尔科夫模型与前向算法相结合,提出一种生物基因的预测算法.理论证明,该隐马尔科夫模型与经过EM算法优化后的模型具有相同的参数,能够降低计算量,提高计算效率.利用该方法对DNA序列F56F11.4a的外显子进行识别的仿真结果表明,该算法是有效的.

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