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啤酒富含营养，生产周期长，过程复杂，容易被有害微生物污染。但酒精、酒花物质、二氧化碳、二氧化硫等能够抑制细菌生长，以及具有低pH和低氧气含量等不利于细菌生长的环境，因此，啤酒生产中碰到的有害微生物种类并不多，主要集中在几类细菌和野生酵母上。在啤酒的有害微生物中尚未发现含有致病微生物的报告，啤酒中的有害微生物都是致腐微生物或潜在的致腐微生物。