【摘 要】
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【目的】在苹果全基因组中鉴定LIM,通过分析启动子作用元件、保守结构域、基因聚类、基因结构、染色体定位以及组织表达模式,为研究和利用苹果LIM奠定基础。【方法】利用苹果
【机 构】
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中国农业科学院果树研究所/农业部园艺作物种质资源利用重点实验室/国家苹果育种中心
【基金项目】
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国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-27);中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2016-RIP-02);辽宁省博士科研启动基金项目(20180540030);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610182019007)
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【目的】在苹果全基因组中鉴定LIM,通过分析启动子作用元件、保守结构域、基因聚类、基因结构、染色体定位以及组织表达模式,为研究和利用苹果LIM奠定基础。【方法】利用苹果基因组数据库GDR和PLAZA,获得苹果LIM家族成员并进行编号。苹果LIM蛋白氨基酸序列的基本信息通过ExPASy Proteomics Server进行预测,利用Cell-PLoc进行亚细胞定位预测,利用CD-Search Tool进行LIM结构域分析,采用MEGA7软件构建进化树,采用GSDS绘制基因结构,并利用TBtools软件对鉴
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