基于群体转录组解析南荻局域适应的关键因子

来源 :植物科学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：laq_sky

【摘要】

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选取有代表性的10个南荻(Miscanthus lutarioriparius L.Liu ex Renvoize&S.L.Chen)野生居群,以种群转录组数据为基础,对种群局部适应性的关键因子进行研究。首先利用SNP构建

【作者】

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乔匿骎邢世来宋志红易自力闫娟

【机构】

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湖南农业大学生物科学技术学院,中国科学院北方资源植物重点实验室,中国科学院武汉植物园植物种质改良与特色农业重点实验室

【出处】

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植物科学学报

【发表日期】

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2020年6期

【关键词】

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芒属转录组推断基因型局域适应 Miscanthus Transcriptome Phased haplotype Local adaptation

【基金项目】

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国家自然科学基金项目(31971566),中国科学院青年促进会项目(Y829281G02)

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选取有代表性的10个南荻(Miscanthus lutarioriparius L.Liu ex Renvoize&S.L.Chen)野生居群,以种群转录组数据为基础,对种群局部适应性的关键因子进行研究。首先利用SNP构建推断单倍型,分析环境间和推断单倍型间的差异表达基因,并将这类基因分为4类:仅受环境显著影响的基因(E)、仅受单倍型显著影响的基因(G)、受环境和单倍型相互作用显著影响的基因(G&E)以及非显著影响的基因。分析结果显示:G&E和E基因集在种群局域适应中发挥重要作用,

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