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明清时期,泉州气候温热潮湿、人口又稠密,疫病屡有发生。清末,伴随着厦门、福州等通商口岸的开埠,人流之交杂也大大增加了病菌传播的机会。从光绪二十一年（1895年）至光绪三十年泉州地区遭遇到严重的鼠疫危机。根植于本土的传统观念与宗教思想,人们仍延续应对瘟疫的旧方法,举办各种驱疫仪式。因鼠疫的外来性以及当时防疫思想未成熟,使得泉州鼠疫难以控制,但这不代表完全没有医学方面的应对措施。鼠疫肆虐的清末时期,医疗、防护与卫生等观念,也开始于泉州当地衍生并逐渐发展。