位置特异性得分矩阵相关论文
蛋白质是生命活动的主要承担者,确定蛋白质的亚细胞位置对于了解蛋白质功能以及药物设计具有重要意义。在后基因时代,蛋白质序列数......
人类基因组测序的完成导致未知功能和结构的蛋白质序列数目飞速增长,使用传统的生物数据处理方法认知这些蛋白质不仅耗时耗力耗材,......
为了加速蛋白质结构和功能的注解进程，研究如何通过理论计算或统计方法来预测蛋白质在细胞中的定位就成了一个非常重要的研究课题。......
转录调控对基因表达产生着至关重要的影响，转录分为起始，延伸和终止三个阶段，转录起始是基因表达的开始，转录调控元件控制着RNA的修饰......
蛋白质‐核苷酸绑定位点预测对于蛋白质功能研究和药物设计有极其重要的作用。单纯依赖生物学实验来获取绑定位点情况的成本大，耗时......
目的 预测蛋白质二级结构是预测其空间结构的基础,提高蛋白质二级结构的预测率非常重要.方法在本研究中,结合氨基酸的疏水性与含有......
目前国内外对于DNA-蛋白质绑定位点预测的研究大多集中在仅以蛋白质序列信息或仅以蛋白质结构信息为基础进行计算,而二者结合所实......
提出一种蛋白质亚细胞定位预测方法.该方法以位置特异性得分矩阵和基因本体抽取对应特征,结合支持向量机构建多标签分类模型.充分......
正确地识别蛋白质-二磷酸鸟苷（Guanosine Diphosphate,GDP）绑定位点对于蛋白质功能分析和药物设计有非常重要的意义。蛋白质-GDP绑定......
将蛋白质序列的ATP绑定位点与非绑定位点进行分类是个不平衡的二分类问题,其中绑定位点是样本数目稀少的正类样本,非绑定位点是样......
蛋白质-核苷酸绑定位点预测对于蛋白质功能研究和药物设计有极其重要的作用。单纯依赖生物学实验来获取绑定位点情况的成本大,耗时......
为了提高蛋白质相互作用位点预测的精度,该文基于蛋白质位置特异性得分矩阵(Position specific scoring matrix,PSSM),提出了一种......
为提高跨膜蛋白两亲螺旋区域（Amphipathic helices,AHs）预测的精度,基于蛋白质位置特异性得分矩阵、二级结构以及疏水矩,提出了一种......
转录因子结合位点是一段短的DNA序列,长度一般在10bp～30bp之间,它通常位于被调控基因上游的启动子区域中,转录调控蛋白与这些序列结......
获取真核细胞中细胞核内蛋白质定位的信息对注解蛋白质功能具有非常重要的意义。针对于利用计算方法预测蛋白质在亚核水平上的定位......
通过Ⅲ型、Ⅳ型、Ⅵ型分泌系统,革兰氏阴性菌可将效应蛋白直接注入宿主体内,并导致宿主感染各种疾病.由于Ⅲ型、Ⅳ型分泌效应蛋白......
蛋白质必须处于正确的亚细胞位置才能行使其功能。文章利用PSI-BLAST工具搜索蛋白质序列,提取位点特异性谱中的位点特异性得分矩阵......
X射线晶体结构分析是测定蛋白质结构的重要方法之一,国际蛋白质数据库(PDB)中已知晶体结构的蛋白质80%~90%均是使用该方法得到的。......
蛋白质棕榈酰化是一种可逆的蛋白质翻译后修饰,在蛋白质稳定性和亚细胞定位等方面发挥重要作用。构建了一种预测蛋白质棕榈酰化位......
基于支持向量机算法,本文提出了一种能快速准确区分癌细胞经典分泌蛋白与非经典分泌蛋白的方法.通过严格的特征筛选,氨基酸组成、......
革兰氏阴性菌细胞中至少存在八种分泌系统,而每种分泌系统分别由一系列具有特定结构与功能的蛋白质组成。因此,对不同类型的细菌分......
获取凋亡蛋白亚细胞定位的信息对揭示细胞程序性死亡的机制和注解蛋白质功能都具有非常重要的意义。鉴于实验方法确定亚细胞定位不......
本文提出了一种基于SVM快速识别革兰氏阴性菌分泌系统蛋白的方法.该方法以氨基酸组成和位置特异性得分矩阵为最优特征集,充分考虑......
蛋白质只有处于特定的细胞器如线粒体、细胞核、细胞质等,才能参与正常的生命活动。蛋白质亚细胞定位信息可以为蛋白质功能的预测......
