转录因子结合位点相关论文
人SLC15A3基因及编码蛋白属于POT家族,其表达上调参与炎症反应的发展,然而,SLC15A3调控和功能的完整机制仍有待研究。通过生物信息学......
了解DNA-蛋白质结合的特异性对于理解基因表达、调控机制和基因治疗有着重要的意义,而转录因子是一种常见的DNA结合蛋白。转录因子......
基因表达调控是理解生物体遗传机制,破解生物体奥秘的关键所在。转录是基因表达至关重要的一步,对转录因子结合位点进行识别与注释......
真核生物细胞的分化、发育以及对环境变化的响应等基本生物学过程决定于时空特异性的精确的基因表达,基因转录是基因表达的第一步,......
哺乳动物中的印迹基因以亲本特异性的方式进行表达,现阶段已有数百个印迹基因在人类和小鼠中鉴定出来,虽然印迹基因数目所占全基因......
基因的表达调控是许多生物学过程正常有序进行的基础。在转录水平上,作用于基因表达的主要调控因子包括转录因子及表观修饰。转录......
棉花是世界上最重要的纤维作物,是我国重要的战略物资。株型是棉花的重要农艺性状,不仅影响产量,还是影响机械化采收的关键指标。......
计算机方法识别转录因子结合位点(transcription factor binding sites,TFBS,也称motif,、模式)是目前生物信息学的一个很有吸引性......
自人类全基因组计划以来,对转录因子以及其结合位点的研究成为人类探索生命本质的重要课题。转录因子只有在与特定的结合位点结合之......
将粗糙集理论应用于生物信息学,是上个世纪末以来许多科研工作者一直关注的研究热点,而且越来越多的被应用于生物信息学的各个方面......
DNA元件百科全书计划(EncyclopediaofDNAElements,ENCODE)的研究表明人类基因组蓝图是一个复杂的网络系统。认识和解读人类基因组蓝......
随着生物信息学的发展,全基因组序列不断被测序,对于转录的研究变得越来越重要。转录因子,作为一种重要的转录调控元件,它与DNA序列的......
在植物乳杆菌中,低聚果糖(FOS)的代谢受到全局调控和局部调控的双重作用。前期研究发现,Ccp A已被确定为植物乳杆菌参与FOS代谢的......
对于多细胞真核生物来说,细胞的特异性功能是十分重要的。这就要求在相同遗传物质的基础上,细胞能够通过不同的基因表达模式来适应......
在DNA序列中识别保守的模式,即模体发现,主要用于在DNA序列中定位转录因子结合位点,对研究基因的表达调控有着重要的意义。此外,高......
在人类基因组中,基因能呈现出高低不同的表达水平和丰富多彩的表达模式。然而,数以万计的基因是由为数不多的转录因子所调控。目前......
昆虫中多种乙酰胆碱酯酶基因的存在,使不同乙酰胆碱酯酶的表达谱和功能研究成为热点之一。家蚕也存在两种乙酰胆碱酯酶基因:Bm-ace1......
miRNAs(MicroRNAs)是一类约为22个核苷酸组成的非编码RNAs(Lagos-Quintanaet al.,2001;Lau et al.,2001;Lee and Ambros,2001),其来......
抗菌肽是具有抗菌活性的一类多肽物质,是畜禽免疫系统执行免疫功能的重要效应物质,参与了畜禽的先天免疫应答和获得性免疫应答。通......
作为一种重要的转录调控元件,转录因子结合位点的识别已经成为当前的研究热点。准确的预测、识别算法有助于人们识别不同转录因子......
2003年4月,随着破译生命密码的人类基因组计划完成,后基因组时代已经拉开序幕,如何利用人类基因组计划所测得的数据进行研究,发现基因......
后基因组时代,高通量数据的产生和分析是生物医学研究中的一个重要现象和重要任务,因此面向全基因组数据的分析方法研究和工具开发应......
羊痒病是一种传染性海绵状脑病(TSEs),是由正常的宿主细胞型朊蛋白构象改变且在中枢神经系统中积累引起的。山羊痒病是由以α螺旋......
基因转录调控一直是生物学研究的重要内容,实质是转录因子与其在基因组序列中对应的短的DNA序列(5-25bp)结合,调控靶基因的表达。前......
碱性神经酰胺酶2(alkaline ceramidase2,ACER2)是一个参与脂质类信号分子神经酰胺代谢的酶分子,在细胞增殖、衰老和凋亡等过程中起......
本实验中是在前期拼接获得12847bp的山羊Agou打基因序列(EF587236和JN651404),和对其进行启动子活性区域预测所确定的候选启动子区......
基因表达(geneexpression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA中的遗传信息转变成具有生物活性的蛋白质分子。这一过程要经过转录和......
该文从挂篮荷载计算、施工流程、支座及临时固结施工、挂篮安装及试验、合拢段施工、模板制作安装、钢筋安装、混凝土的浇筑及养生......
为了寻找启动子区域上转录因子结合位点的分布规律,进而研究这种规律与真核基因表达调控机制之间的关系,该文从已有数据出发,运用......
目的:对人Mcl-1基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从Gene Bank数据库中获取人Mcl-1基因5’调控区,使用在线软件JASPA......
单细胞绿藻--雨生红球藻在逆境条件下积累大量的虾青素.β-胡萝卜素酮化酶(bkt)催化在β-胡萝卜素和玉米黄素的β-紫罗酮环C-4位引......
目的 p73基因含有两种不同的启动子结构,转录生成一些具有不同甚至相反的功能特性的异构体.利用生物信息学相关软件比较这两种p73......
目的 研究AP-1和ETS-1转录因子结合位点(TFBS)缺失对树突状细胞特异性胞间黏附分子-3结合非整合素(DC-SIGN)启动子活性的影响,探讨......
本研究通过随机突变对毕赤酵母甲醇诱导型强启动子PCAT1进行改造,以绿色荧光蛋白为表征,经过高通量筛选,获得一个活性范围为25.57%......
目的:扩增乙酰肝素酶(heparanase,HPSE)基因启动子核心片段,并进行序列分析。方法:提取人类基因组DNA,PCR扩增HPSE基因启动子,T—A克隆、酶......
为了掌握鸡Lpin1基因组内微卫星的分布特性,采用SSR hunter软件搜索位于鸡Lpin1基因组序列内的微卫星序列,并采用非变性聚丙烯酰胺凝......
细胞病变或应激过程中会发生多个涉及基因表达调控的生物学事件,其中以转录因子-DNA结合为核心的基因转录调控模块的功能的激活或失......
目的研究人类CIM+T细胞全基因组核小体抑制和激活状态下的定位模式,转录因子结合位点(Transcription factor bindingsite,TFBS)分布特征......
哺乳动物皮肤具有多种功能,这些功能是由基因决定的,而基因的表达要受到转录因子的调节。本研究通过参照人皮肤基因的转录因子分析羊......
定位转录因子结合位点,也称模体发现问题,对于理解基因调控关系非常重要.文中提出了一种新的定位投影求精算法(Fixed-Position Proj......
基于在转录因子结合位点各碱基出现的概率不相同,以转录因子结合位点每一位置的碱基保守程度为参量,分别计算每种转录因子结合位点在......
转录因子结合位点的识别是阐明基因转录调控机制的重要环节,准确的转录因子结合位点的预测算法将有助于人们识别转录因子的目标基因......
本文介绍了一种利用转录因子结合位点应用计算机技术对人类肿瘤特异性启动子进行预测的方法.实验结果证明该方法具有较高的准确性.......
利用DNA中转录因子结合位点分布的序列比较方法对DNA序列进行聚类,并分析基因之间的联系。运用Matlab工具结合TRANSFAC数据库中的......
以一组随机选取的对照序列中寡核苷酸的出现频率为基础,分析转录频率较高的酵母基因内含子序列的寡核苷酸使用情况,抽提出一批过表达......
转录因子结合位点的识别对于理解转录调控机制起着重要作用,也是后基因组时代面临的巨大挑战之一。提出一个基于多任务学习的转录......
DNA序列中保守序列的识别需要较大的计算量。开发了一个转录因子结合位点识别的并行算法,能够从多条DNA序列中识别指定长度的序列模......
真核基因的转录调控是后基因组时代研究的主要问题之一,其基础是认识DNA上转录因子结合位点(模体)及分布状况。基于马尔可夫链模型对......