模体识别相关论文
蛋白质是重要的生物大分子,执行催化、免疫、受体结合等生物学功能。蛋白质是以氨基酸为基本单元形成的一条或多条长链。在自然环境......
揭示基因组水平上的基因表达调控规律是生物信息学和分子生物学所面临的挑战性问题之一。转录调控是基因表达调控的关键步骤,转录......
DNA模体识别问题是生物信息学研究的最核心的问题之一。模体蕴含着丰富的生命特征信息。模体识别技术的出发点是找出序列间的相似......
生物信息领域中,批量蛋白质同源性搜索和模体识别是当今的两个研究热点。本文针对批量蛋白质同源性搜索问题和模体识别问题,提出了......
模体识别是生物信息学的重要研究领域。它通过寻找不同序列间的相似片段来归结出这些序列片段中所蕴涵的特征模体,从而揭示生物序列......
生物体基因的表达借助于具有调控作用的蛋白质和DNA序列中的调控位点的结合来完成,而调控位点出现在相关基因的上游调控区域,并且通......
研究空中交通网络的结构特征是理解网络性质的重要手段.从局部角度出发,以构成空中交通网络的子图结构为研究对象,对其模体特性进......
卤醇脱卤酶是一类重要的蛋白质,它不仅能通过开环反应催化有毒污染物的降解,还能作为亲核试剂促进高价值药物中间体的生成。卤醇脱......
电子系统受到复杂电磁环境的影响可能会导致失灵甚至损毁,而传统的电磁防护存在防护主动性和自我修复性差等缺点,因此急需寻找新的......
DNA序列模体对研究基因的表达调控有重要作用,模体识别问题是计算生物学中一个热点问题。本文就模体识别问题做了相关的介绍并提出......
RNA聚合酶的主要功能是利用DNA来制造RNA。在转录过程中,RNA聚合酶使用DNA作为模板并使用腺嘌呤脱氧核苷酸(A)和胸腺嘧啶脱氧核苷酸......
学位
通过模体识别可以获得生物网络结构和功能,生物网络模体识别过程涉及到子图枚举和子图同构的问题,计算量非常大.提出一种高效的网......
针对传统的生物计算中DNA序列保守序列的识别(模体识别)和最长公共子序列计算需要较大的数据量、计算量,以及功耗大等问题,文中提出了......
针对生物序列模体的识别问题,提出了一个新的混合Gibbs抽样识别算法.算法基于混合模体模型学习,采用贪心策略,通过似然度最大化,逐......
模体是刻画蛋白质家族组成结构和执行功能的重要部分,但是对于通过各种生物信息学方法识别出的模体,目前没有很好的办法辨别真假和......
为了避免传统吉布斯算法的诸多缺陷,提高算法的求解能力,对蚁群算法(ACO:Ant Colony Optimiza-tion)进行了改进:引入粒子群算法(PSO:Part......
对优化问题和游牧民族迁徙行为的比较研究表明,两者存在相似之处,文中模拟了游牧民族迁徙机制,提出了一种迁徙策略,并且与粒子群优化算......
染色质免疫共沉淀技术将模体识别问题拓展到了全基因组范围,但因数据量过大,传统的模体识别算法往往运算过慢从而无法很好地解决此问......
为了克服微分进化的局部收敛问题,通过模拟游牧民族的迁徙机制,提出一种迁徙策略,将其与差分进化算法相结合,得到一种迁徙差分进化算法......
DNA序列中保守序列的识别需要较大的计算量。开发了一个转录因子结合位点识别的并行算法,能够从多条DNA序列中识别指定长度的序列模......
模体识别是指寻找一系列功能相近且形式相似的基因片段.为此将MCL聚类算法引入模体识别应用,设计出一种适用于这个问题的新算法,在......
生物技术尤其是高通量测序技术的发展使得人们能够更加方便地获取海量的生物数据。然而生物数据的爆炸式增长给人们带来无限发展机......
作为表观遗传修饰的一个基本的组成部分,DNA甲基化在维持正常细胞功能、细胞分化与增殖、遗传印记、生物体老化、胚胎发育以及人类......
模体识别是运用计算机算法寻找一系列功能相近且形式相似的DNA序列片段,从而找出生物信息学中控制基因表达调控机制的转录因子结合......
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借鉴Gibbs采样思想,将序列峰值所对应的候选模体作为遗传算法的初始种群,提出一种改进的模体识别算法。将模体在序列中的出现次数作......
基因组计划的实施,使序列数据激增,序列分析成为生物信息学的首要任务。序列比对与序列模体(motif)识别是进行生物序列分析的两个......
近年来,基因组计划的实施,使得DNA序列数据激增,对产生的海量序列进行有效地分析成为生物信息学的首要任务之一.其中,基因非编码区的解......
基因组上众多基因和非编码转录体按照特定的规律有序地表达是细胞正常生命活动的基础。转录调控是基因表达调控的关键步骤,转录因......
转录因子结合位点识别在基因表达调控过程中起着重要的作用.文中提出了一种贝叶斯模型驱动的模体识别的遗传优化算法GOBMD(Genetic ......
生物序列中的模体对DNA的转录、翻译起着重要作用,因此对生物序列中模体的识别具有重大意义和理论价值,模体识别问题成为了生物信......