大肠埃希菌O157∶H7产生的最主要的毒力因子是志贺毒素.该毒素是由1个A亚单位和5个B亚单位组成的.B亚单位分子量为7.7Kda,它是由五个多聚体组成,能与细胞膜上特定的糖苷,即神经酰胺三已糖苷(Gb3)结合.B亚单位一旦与受体结合后,通过胞吞作用A亚单位进入细胞质中,由于A1具有N1-糖苷酶活性,它可切断28S rRNA5'端4323位腺嘌呤的N-糖苷键,腺嘌呤脱落使tRNA不能与60s核糖体结合,从而抑制真核细胞蛋白质的合成.因此,对于Stx2与底物腺苷相互作用的研究有助于以Stx2为靶标的抗菌药物的研发,具有重要的意义.在本文中,首次采用分子对接方法将腺苷对接到志贺毒素2(Stx2)的活性结合位点中,然后在常规分子动力学优化的稳定构型基础上,对其构象进行了分析.并采用MM-PBSA方法,进行了结合自由能分解及总的结合自由能的计算.结果表明：在腺苷-Stx2复合物体系中主要结合位点氨基酸残基主要为：Ser113,Arg119,Arg125,Arg170,Asp195,Asp197,Ash201.其中,在复合物体系中腺苷分子中的N原子可与蛋白中的Arg125氨基酸侧链形成一个较强氢键作用,而腺苷分子中的羟基可与蛋白分子中的Ser113氨基酸的主链形成一个较强氢键作用.同时,本文也对Stx2活性位点结合产物腺嘌呤及结合底物腺苷后构象变化情况进行了分析.结果表明,在晶体结构中,腺嘌呤比腺苷距离氨基酸残基Va178,Tyr77,Arg170具有更近的距离,而腺苷结合位点低于腺嘌呤的结合位点.这种结合位置上的差异主要是由于在腺苷-Stx2复合物体系的催化反应过程中,腺苷中腺嘌呤部分与氨基酸残基Arg125,Arg170相互作用,从而受到牵引作用,而腺苷中的另一部分——呋喃环与氨基酸残基Ser113,Arg119相互作用,受到了一个相反方向的牵引力,导致Stx2的催化产物腺嘌呤结合位点位置与底物腺苷具有一定的差异.以上结果表明,Stx2蛋白与底物腺苷结合位点处氨基酸残基为蛋白催化活性中心,底物为腺嘌呤.