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HI-13 串列加速器辐射防护联锁系统建立在原有HI-13 串列实验室辐射防护联锁系统之上，更新了现场硬件如防护门控制箱、报警装置和指示灯箱,增加了关门清场功能和开门授权功能，同时建立了以PLC 和上位机软件为基础的计算机控制系统；新的控制系统优化了原有的控制逻辑，考虑了各种可能出现的工作常态和突发状态，建立了完善全面的辐射联锁保护机制，在保证工作人员辐射安全的同时，还有效保障了设备的安全，未改进前联锁错误或操作错误会导致加速器停机，改进后的软件控制增加了操作提醒，并改为首选利用像点法拉第筒切断束流，如切断失败，则低能端法拉第筒切断束流，停机仅作为最终切断束流方式被自动执行。