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利用RAPD技术和微卫星标记对不同基因组组合的鱼类进行了基因组指纹图谱构建；报道了3个鲤鱼微卫星标记的特征及其多态性应用于遗传变异研究上的特殊意义，在受试的六种生物型中，MFW2，MFW8和MFW16座位各自存在12，16和10个等位基因。RAPD研究发现，在26个随机引物扩增的产物中平均每个个体观察到约142个RAPD标记，单个引物获得的标记平均为5.4，其中4个引物扩增的图谱可将不同的生物型区分开，六种生物型均存在基因组特异性的图谱即各自独特的“诊断性”图谱，由此作者建立了详细的分子标记检索表。通过对微卫星标记和RAPD图谱的量化分析，利用UPGMA构建了不同生物型的遗传关系树系图。本研究发现，微卫星和RAPD分析两种手段反映6种生物型之闻的聚类模式完全一致。然而由微卫星标记获得的生物型内和生物型之间的遗传距离均大于RAPD的，此结果表明微卫星标记在揭示群体内个体间差异上具有独到之处。实验表明，该技术以灵敏、简捷等特性应用于鱼类品系鉴定方面显示出血型血清学、蛋白质多态性无可比拟的优势。