【摘 要】
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目的:膀胱癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一,老年人因其免疫力低下,泌尿系统功能退化等因素,是膀胱癌的高发人群。越来越多的研究证据表明,长链非编码RNA（lnc RNA）在各种癌症中起到了关键的调控作用,是近年来研究肿瘤标志物的新兴目标之一。lnc RNA对癌症的调控涉及诸多机制、假说,但与竞争内源性RNA（ce RNA）机制密不可分。而lnc RNA对膀胱肿瘤的调控是一个复杂的过程,更是涉及到了mi
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目的:膀胱癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一,老年人因其免疫力低下,泌尿系统功能退化等因素,是膀胱癌的高发人群。越来越多的研究证据表明,长链非编码RNA（lnc RNA）在各种癌症中起到了关键的调控作用,是近年来研究肿瘤标志物的新兴目标之一。lnc RNA对癌症的调控涉及诸多机制、假说,但与竞争内源性RNA（ce RNA）机制密不可分。而lnc RNA对膀胱肿瘤的调控是一个复杂的过程,更是涉及到了mi RNA、m RNA等因素,本研究的目的是通过将三者的表达数据提取,利用其差异基因建立起老年患者膀胱肿瘤的特异性ce RNA调控网络,进行GO与KEGG富集分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并进行生存分析,从而寻找到可能的老年膀胱肿瘤生物标志物,为其诊断及治疗等提供依据。方法:检索癌症基因组图（TCGA）数据库,下载其中年龄≥60岁患者膀胱癌相关的基因表达谱数据及临床资料。使用Perl软件对下载的基因表达谱数据进行整理得到基因矩阵,并匹配对应的Ensemble ID。使用R软件的edg R包对得到的基因矩阵进行分析,筛选出其中差异表达的lnc RNA、m RNA、mi RNA。在mi Rcode、mi RTar Base、Target Scan、mi RDB数据库中下载相关信息,再次使用Perl软件、R软件得到差异表达的lnc RNA、m RNA、mi RNA的相互作用对并预测相关靶基因。将得到的相互作用对导入Cytoscape软件绘制ce RNA的调控网络图。对得到的差异基因使用R软件进行Kaplane-Meier单因素生存分析,得到其中与膀胱癌预后相关的基因。应用R软件进行分析,得到其GO与KEGG的富集图;导入String在线数据库,构建PPI网络。结果:共筛选出在老年膀胱肿瘤中有717个lnc RNAs,1819个m RNAs,158个mi RNAs存在显著的差异表达。进一步筛选出用于构建ce RNA网络的62个lnc RNAs,73个m RNAs,23个mi RNAs。将得到的差异基因进一步处理,进行生存分析,得出其中与老年膀胱肿瘤患者的生存预后相关的15个lnc RNAs,7个m RNAs,3个mi RNAs。GO富集分析主要为以下两类,生物学过程（Biological Process,BP）和细胞成分（Cellular Component,CC）;KEGG富集分析得出其集中分布的相关通路;构建出PPI网络,得出基因对应的蛋白与其相互作用关系。结论:本研究主要利用了TCGA数据库中相关数据,最终构建ce RNA网络并得到了老年膀胱肿瘤患者密切相关的15个DElnc RNA,7个DEm RNA和3个DEmi RNA。其中大多数RNA与膀胱肿瘤发生、发展及预后的关系得到了证实,但在老年膀胱肿瘤的生物学标志物中仍有着相关的RNA值得被探索、被研究。而lnc RNA AC025594.2与PDZRN3-AS1将作为本研究后续阶段的重点研究对象,探究其与老年膀胱肿瘤发生发展以及预后等方面的关系以明确其临床价值。
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