合浦珠母贝PU3及PU6基因的克隆与功能研究

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合浦珠母贝是一种重要的珍珠养殖贝类,它的矿化机制也吸引着生物矿化领域研究者的注意力。本论文针对合浦珠母贝的蛋白质组学及转录组组学的数据进行分析,筛选出了两种含有纤连蛋白第三结构域的基质蛋白——PU3及PU6。本研究对这两种蛋白进行了基因克隆和功能鉴定,对这两种蛋白在合浦珠母贝贝壳的矿化过程中的作用进行了初步的探究。基于合浦珠母贝转录组及蛋白质组的数据,通过RACE技术克隆获得了PU3与PU6的c DNA序列全长;运用NCBI提供的多种软件分析了PU3及PU6基因的c DNA序列及其对应蛋白的氨基酸序列;通过q PCR的方法检测了两种基因在合浦珠母贝不同组织中的表达情况;利用贝壳损伤实验及RNAi实验对这两种基因在贝壳矿化过程中的功能做了初步的探索。PU3基因的c DNA全长为2361 bp,其中开放阅读框为1857 bp,编码618个氨基酸残基。PU3的理论分子量为68.73 k Da,理论等电点为6.53,包含4个纤连蛋白第三结构域。PU3基因在外套膜中高表达。在贝壳损伤修复的过程中,其表达量会显著上升,并持续维持在一个较高的表达水平。RNAi实验显示,抑制PU3基因的表达会改变贝壳棱柱层的结构,边界会变得粗糙,棱柱状晶体中会出现空洞。根据以上结果推测基质蛋白PU3在合浦珠母贝棱柱层矿化中起到关键作用。PU6基因的c DNA全长为2135 bp,其中开放阅读框为1863 bp,编码620个氨基酸残基。PU6的理论分子量为69.09 k Da,理论等电点为8.74,包含4个纤连蛋白第三结构域。PU6基因在外套膜中特异性表达,在贝壳损伤修复的过程表达量会明显上升。RNAi实验的结果表明,将PU6基因的表达抑制后,贝壳棱柱层的结构会发生明显改变,边界变粗糙且缝隙变大。根据以上结果推测基质蛋白PU6在合浦珠母贝棱柱层矿化的过程中发挥了作用。综上所述,本研究证实了基质蛋白PU3和PU6在合浦珠母贝的生物矿化过程中有着一定的功能,并且主要在贝壳棱柱层的矿化过程中发挥作用,抑制其表达会破坏棱柱层的结构。本研究可以补充对贝壳生物矿化的理解,丰富对贝壳矿化系统的研究。
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