【摘 要】
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本试验研究了绵羊卵巢、下丘脑和垂体组织中lncRNA在卵泡期与黄体期的差异,并选取差异表达lncRNA靶向的FecB、MSTN、HSP60进行基因多态性与生长性状的关联分析,旨在筛选出与繁殖和生长性状相关的差异表达lncRNA,同时为研究调控家畜繁殖性能和生产性能的调控机制提供研究思路和理论依据。试验一:绵羊lncRNA的筛选、靶基因预测与功能分析本试验对比组合如下:1.卵泡期湖羊下丘脑（HAF）
【基金项目】
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财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助（CARS-38）；
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本试验研究了绵羊卵巢、下丘脑和垂体组织中lncRNA在卵泡期与黄体期的差异,并选取差异表达lncRNA靶向的FecB、MSTN、HSP60进行基因多态性与生长性状的关联分析,旨在筛选出与繁殖和生长性状相关的差异表达lncRNA,同时为研究调控家畜繁殖性能和生产性能的调控机制提供研究思路和理论依据。试验一:绵羊lncRNA的筛选、靶基因预测与功能分析本试验对比组合如下:1.卵泡期湖羊下丘脑（HAF）:黄体期湖羊下丘脑（HAL）;2.卵泡期湖羊垂体（PAF）:黄体期湖羊垂体（PAL）;3.卵泡期湖羊卵巢（OAF）:黄体期湖羊卵巢（OAL）;4.卵泡期脂尾羊卵巢（OZF）:黄体期脂尾羊卵巢（OZL）;5.卵泡期湖羊卵巢（OAF）:卵泡期脂尾羊卵巢（OZF）;6.黄体期湖羊卵巢（OAL）:黄体期脂尾羊卵巢（OZL）。HAF:HAL组鉴定到1024个差异表达lncRNA;PAF:PAL组鉴定到498个差异表达lncRNA;OAF:OAL组鉴定到1379个差异表达lncRNA;OZF:OZL组鉴定到734个差异表达lncRNA;OAF:OZF组鉴定到768个差异表达lncRNA;OAL:OZL组鉴定到683个差异表达lncRNA。通过qRT-PCR验证证明,随机选取的差异lncRNA定量结果与测序结果基本一致,确定了测序结果的可靠性。通过对差异表达lncRNA的靶基因进行GO和KEGG富集分析结果表明,差异表达的lncRNA及其靶基因主要参与卵泡发育、排卵周期过程、钙离子信号通路、卵母细胞减数分裂、催产素信号通路、MAPK信号通路、甲状腺激素合成通路、雌激素信号通路。关键的lncRNA可能通过调控参与这些信号通路和生物学过程的基因来调控繁殖和生长发育。其中,LNC＿011239、LNC＿012847、LNC＿003902、LNC＿003906、LNC＿003907等靶向的MAPK1、ADCY1、ADCY5、PPP3CA和CDC23可能发挥关键的调控作用;LNC＿002202可能参与下丘脑、垂体、卵巢功能和繁殖的调控,与调控黄体期到卵泡期发情状态的转换、湖羊发情启动有关;LNC＿006321可能对湖羊产仔数等繁殖调控相关有影响。试验二:不同绵羊群体FecB MSTN和HSP60基因多态性与生产性状的关联分析本试验选取差异表达lncRNA靶向的FecB、MSTN、HSP60进行基因多态性与生长性状的关联分析,在四个绵羊群体中均检测到突变位点,其中FecB基因的表型为B+型和++型,MSTN基因的表型为AA型、AC型和CC型,HSP60基因的表型为AA型、AG型和GG型。MSTN基因的CC基因型在萨杜湖杂交绵羊群体中的体斜长显著高于AA基因型（P＜0.05）,CC基因型在澳杜湖杂交绵羊群体中的管围显著高于AA基因型（P＜0.05）;HSP60基因的GG基因型在萨杜湖杂交绵羊群体中的体重、体高和胸围均显著高于AG基因型（P＜0.05）。综上所述,MSTN、HSP60基因对绵羊的生长性状有显著影响,可作为肉羊生长发育和产肉性能方面的候选基因,与其有靶标关系的lncRNA也可能在绵羊生长发育中发挥作用,具有一定的参考价值。MSTN、HSP60基因SNP位点可以作为优质肉羊培育中生长性状的潜在分子标记,为绵羊的选育工作提供理论依据。
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