基于生物信息学分析鉴定肺腺癌长期生存相关基因与预后价值评估

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zx19910412
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[目的]肺癌包括小细胞肺癌和非小细胞肺癌两种主要类型,其中肺腺癌是非小细胞肺癌最常见的病理亚型。目前,肺腺癌的治疗主要包括手术切除、化疗、放疗和分子靶向治疗。然而,与许多癌症的生存率稳步提高相比,肺腺癌的总生存率并未显著提高,主要是由于其终末期缺乏有效的治疗靶点。因此,迫切需要对肺腺癌中该人群进行分层和生物标志物的筛查,以探索新的治疗靶点,为减轻患者症状和延长生存期提供可能。[方法]本研究主要基于肺腺癌的肿瘤基因组图谱数据库(TCGA),从中获取基因表达数据和相关临床信息,鉴定与长期生存相关的基因,并对这些基因的生物学功能进行分析。利用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、生存分析和基因-转录因子调控网络、qPCR实验验证来确定可能影响肺腺癌患者发病机制和预后的潜在关键基因,并探索了可能作用于这些基因的靶向药物。[结果]共验证了肺腺癌中的159个长期生存相关基因。利用PPI网络筛选了 7个基因(ZIC5、ZIC2、HOXA13、POU3F2、SALL1、DLX1 和 MNX1)作为核心基因。通过生存分析,五个基因(DLX1、HOXA13、ZIC2、SALL1和ZIC5)被确定为预后基因。KEGG通路富集分析提示这五个基因参与了细胞周期、核质转运等信号通路。基因-转录因子调控网络提示了 EZH2和ZBTB7A调控了所有5个预后基因。基因-药物网络提示有117种药物靶向预后基因。应用qPCR检测肺腺癌样本,相比于正常组织样本中的DLX1、HOXA13、ZIC2、SALL1和ZIC5明显上调,与TCGA数据库的数据一致。[结论]本研究探索了 DLX1、HOXA13、ZIC2、SALL1和ZIC5的表达与肺腺癌长期生存相关,并展现了其预后价值,加深理解了肺腺癌的发生发展机制,为临床预后和治疗提供依据。
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