TRIM59对肝细胞癌细胞增殖及免疫浸润的影响

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:julian
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:研究TRIM59在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)中对细胞增殖和免疫浸润的影响及其临床意义。方法:(1)基于The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库中的33种肿瘤,分析TRIM59在泛癌中的表达情况和临床意义。(2)利用TCGA-LIHC(Liver hepatocellular carcinoma)、GTEx、GSE25097数据集和HPA数据库分析TRIM59在HCC肿瘤组织与正常组织中的m RNA和蛋白水平上的表达差异。(3)利用Kaplan-Meier Plotter(KM)和TCGA数据库,分析TRIM59与HCC患者临床特征及预后的关系。(4)分别在基因突变、甲基化以及上游mi RNA层面分析TRIM59在HCC中高表达的潜在机制。(5)基于linkedomics数据库分析HCC中与TIRM59表达相关的基因集,并进行Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析;基于STRING数据库分析TRIM59的蛋白质互作(Protein-protein interaction,PPI)关系。(6)通过TIMER、TIMER2.0、TISIDB数据库分析TRIM59对HCC免疫微环境的影响包括与免疫细胞浸润及免疫检查点抑制剂(Immune checkpoint check-point inhibitors,ICIs)的关系,并进一步基于目前学者们提出的几种HCC免疫分型类型,分析TRIM59可能导向的HCC免疫分型方向。(7)通过聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot,WB)验证TIRM59在HCC中的差异性表达。(8)通过CCK8、克隆形成实验和磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(PI3K-AKT)通路实验探究TRIM59对HCC细胞增殖的影响及潜在机制。结果:(1)TRIM59在18种TCGA肿瘤中高表达,且是影响KIRP(Kidney renal papillary cell carcinoma)和LIHC预后指标总生存期(Overall survival,OS)、疾病特异性生存期(Disease special survival,DSS)、无进展间歇期(Progression free interval,PFI)的危险因素。(2)TRIM59在HCC肿瘤组织中明显高表达;亚组分析显示,TRIM59的表达在不同的T、N、M分期,病理分期、组织学分级、血清甲胎蛋白(Alpha fetoprotein,AFP)水平及不同的年龄、性别亚组中存在明显差异;logistic回归分析表明年龄、性别、T分期、病理分期、组织学分级,以及AFP和体质指数(Body mass index,BMI)是影响HCC中TRIM59表达的主要因素。(3)TRIM59影响了HCC患者的OS、无复发生存期(Relapse free survival,RFS)、无进展生存期(Progression free survival,PFS)、DSS预后;亚组分析显示,在索拉菲尼治疗组、组织学分级G1组、男性组、无血管侵犯组、病理分期I期组中,TRIM59显著影响了患者预后OS,尤其是索拉非尼治疗组;单、多因素Cox回归分析表明TRIM59是影响HCC患者OS、DSS、PFI预后的独立危险因素。(4)hsa-mi R-328-3p可能是导致HCC中TRIM59高表达的潜在调控因素之一。(5)HCC中TRIM59表达相关的基因集GO和KEGG富集分析显示与细胞周期和细胞分裂等增殖相关的信号通路与生物学过程明显富集,PPI互作显示TRIM59蛋白与ESR1、STAT3、EGFR、CCND、IGF1R等蛋白联系密切。(6)TRIM59明显影响了HCC中免疫细胞的浸润,尤其是与骨髓来源的抑制性细胞(Myeloid-derived suppressor cell,MDSC)、调节性T(Treg)细胞、肿瘤相关的成纤维细胞(Cancer associated fibroblasts,CAF)这类免疫抑制性细胞浸润明显正相关;与免疫抑制性分子标志包括耗竭性T细胞、Th17的细胞标志及几乎所有的ICIs,尤其是PDCD1、CTLA4、TIGIT、TGFBR1、TGFB1明显正相关。(7)HCC中TRIM59的高表达可能导致患者免疫分型更偏向:Sia的免疫衰竭型、Schulze的增殖型、i Clusters 1型、Shimada的MS1型,Zhang的免疫抑制亚型、Fujita的Treg亚类以及Liu的TIME-2型,尤其是Shimada的MS1型、Zhang的免疫抑制亚型和Liu的TIME-2型。(8)TRIM59在HCC细胞系中明显高表达,包括m RNA和蛋白质水平。(9)HCC细胞中TRIM59的敲低,抑制了肿瘤细胞增殖和克隆形成,并降低了PI3K-AKT通路的活化。结论:1.TRIM59在HCC中高表达且可能受hsa-mi R-328-3p调控,是HCC预后不良的独立危险因素;2.敲低TRIM59抑制HCC细胞增殖和PI3K-AKT通路的活化;3.TRIM59影响HCC免疫浸润并有助于促进免疫抑制性微环境的形成。
其他文献
随着电动汽车数量的逐年增加,退役动力电池的数量也随之增加,因此对退役动力锂电池进行合理分选,不仅可以更有效地将退役动力电池应用于不同场景,而且可以解决资源利用问题,降低回收成本。然而退役动力电池由于多次充放电循环,其性能较全新动力电池将有所下降,因此研究退役动力锂电池性能估计和分选方法有着重要意义。本文围绕18650型的退役三元锂动力电池展开研究。首先,论文详述了影响退役三元锂动力电池性能的电气参
学位
随着我国逐步步入了新发展阶段,节能、低碳、绿色的发展理念逐渐深入人心。铁路部门也由过去粗放式的发展模式进入到“节支降耗”的关键阶段。高速铁路与其他运输方式相比具有明显优势,但在运营过程中,存在着大型设备的容量浪费和一次投资费用增加的显著问题。通过对系统内牵引变电所和分区所及AT所的容量、数量及位置优化提高设备的利用率。因此,本文以沿线大型所亭为研究对象,进行其数量及位置优化等方面的研究。具体内容如
学位
铁路运输系统作为当今客、货运输的主流方式之一,凭借运行速度快、运输能力强,成本低、安全、可靠等特点,在我国快速的发展。在先进技术的支持下,列车运行控制系统不仅在列车高速运行时保证其安全运营,还在部分运营线路中开始实现列车的自动驾驶。列车运行控制技术的迅猛发展,离不开先进的控制策略。性能良好的控制策略不仅能够控制动车组以很高的控制精度在不同的运行环境中行驶,还能够保证动车组在发生故障时安全运行。本文
学位
目的:探讨成人腹股沟疝发生嵌顿的危险因素,比较不同手术方式治疗嵌顿性腹股沟疝的临床疗效。资料和方法:回顾性分析2019年1月至2020年12月兰州大学第一医院收住的成人腹股沟疝患者,按照纳入排除标准纳入患者,将其分为嵌顿组和非嵌顿组,收集患者临床资料包括性别、年龄、体重指数、吸烟史、糖尿病史、高血压史、抗凝药物使用史、放疗化疗史、长期咳嗽和便秘、腹水、复发、腹部手术史、疝类型及疝环口大小等,采用S
学位
永磁同步电机(Permanent Magnet Synchronous Motor,PMSM)由于其具有高效节能、体积重量小、高转矩密度的优点在航空航天、军事国防、轨道交通、工业生产等领域得到了广泛的应用。由于PMSM驱动系统所安装的机械式位置传感器容易受到恶劣环境等各种因素的影响,难以满足可靠性较高的场合的使用要求,再同时考虑到电机驱动逆变器中主电路功率开关器件的复杂性和高损耗,逆变器在长期高频
学位
随着多智能体系统广泛应用于军事、航空航天、工业和电网等控制领域,如无人机编队控制、卫星编队和智能电网调度等。在实际工程应用中,系统主要表现为非线性,因此研究非线性系统的相关控制问题是非常必要的。非线性多智能体系统的协同输出调节是指在外部系统作用下,非线性智能体跟随者通过智能体间的相互协作使单个智能体的输出渐近跟踪到外部系统信号。非线性多智能体系统的协同输出调节问题主要存在以下问题:受外界干扰信号影
学位
目的:探讨行心脏瓣膜置换(HVR)患者术后左室功能障碍(LVD)的危险因素,建立一个可靠、准确的临床预测模型,为早期识别HVR术后LVD的高危患者提供依据。方法:本研究回顾性连续选取2020年1月至2020年12月在兰州大学第一医院心外科接受HVR治疗的患者作为研究对象。依据纳入和排除标准,最终共纳入了258例患者,收集患者的相关临床资料,根据术后是否发生LVD,将患者分为LVD组和Non-LVD
学位
随着我国高速铁路的快速发展,在中国列车运行控制系统(ChineseControl Train)3-CTCSSystem,基础上增加自动驾驶ATO)Operation,Train(Automatic功能的C3+ATO系统是高速铁路向高质量智能化、高程度自动化迈进的一个重要节点,它也成为智能高铁的发展趋势。在此背景下,C3+ATO系统车载设备作为保障列车运行安全,实现列车自动驾驶的核心技术装备,若其发
学位
目的通过整理胃癌根治术后患者的临床病理资料,探究引起胃癌根治术后复发的危险因素,建立复发预测模型,同时进行预后分析,旨在为胃癌根治术后患者的个体化治疗及随访提供依据。方法采用回顾性研究方法,收集2017年3月1日至2020年3月31日在兰州大学第一医院肿瘤外科行胃癌根治术的患者的临床病理资料,通过病历记录及电话随访明确患者有无复发,根据复发与否进行分组。用二元logistic回归对各临床病理特征进
学位
目的:本研究就新辅助化疗后行腹腔镜胃癌根治术(LAG)与开腹胃癌根治术(OG)的患者术后并发症及中位生存期进行比较,评估新辅助化疗后腹腔镜胃癌根治术在局部进展期胃癌治疗中的安全性及疗效。方法:回顾性分析兰州大学第一医院2017年1月-2020年12月间收治的接受新辅助化疗后行胃癌根治术的局部进展期胃癌患者154例,其中腹腔镜下胃癌根治术52例,开腹胃癌根治术102例。研究首先对两组患者年龄、性别、
学位