资本运营对公司拓宽业务范围，降低交易成本，增强公司核心竞争力尤为重要。2015年到2017年，内蒙古能源建设投资公司开展了大量的资本运营活动。但是，资本运营的效率如何，存在什么问题,需要进行评价总结。在对公司资本运营的组织架构、内容与特点描述分析的基础上，通过构建资本运营投入产出评价指标体系，并根据公司的财务数据，运用DEAP2.1软件测算出公司资本运营效率的Malmquist指数具体值，采用定量分析与定性分析相结合的方法，实证分析公司资本运营效率。研究发现：从全要素生产率指数来看，公司总体资本运营效率呈现出在波动中稳步上升的态势；从技术进步指数的分析可知，公司技术实力、技术水平在整个研究区间内正逐步增强；从综合技术效率指数和纯技术效率指数来看，公司的管理决策的准确性和管理水平仍有待提高；从对规模效率指数变化的分析来看，公司正处于规模报酬递增阶段。在此基础上，结合对公司资本运营发展现状的进一步定性分析，发现公司开展的资本运营活动存在着对后期资本运营项目管理重视不足，更多的是以实现上市为目标而进行资本运营；资本运营以传统方式为主；资本运营地域相对局限等问题。最终提出建立科学的资本运营管理决策机制；组建专业团队；充分利用资本市场开展资本运营活动；持续提升公司内部管理水平等建议。研究结论对内蒙古能源建设投资公司加强资本运营管理，提高资本运营效率具有一定的参考价值。