慢性肾脏病3-5期患者血清FOXO3水平与肾功能的相关性分析

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目的:通过检测慢性肾脏病(CKD)3-5期患者血清FOXO3的水平,探讨其与肾功能的相关性。方法:利用生物信息学的分析方法,筛选出GEO数据库中数据集GSE37171的差异表达基因。分别对上调及下调的差异表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,最终筛选出关键基因。依据纳入和排除标准,收集2020年10月~2021年10月在我院接受治疗的CKD3-5期患者的临床资料共89例,其中CKD3期32例,CKD4期28例,CKD5期29例。纳入我院同期体检的健康者30例为正常对照组。收集研究对象的年龄、性别、体重指数(BMI)、原发病等一般资料。收集CKD3-5期患者的血红蛋白(Hb)、白蛋白(ALB)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、血尿素氮(BUN)、血肌酐(Scr)、血尿酸(UA)、胱抑素C(Cys-C)、血钙(Ca)、血磷(P)等实生化指标。采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定研究对象的血清FOXO3水平。分析CKD3-5期患者血清FOXO3水平与肾功能的相关性。结果:(1)对GEO数据库中GSE37171数据集进行分析后共获得297个上调的差异表达基因,1630个下调的差异表达基因。(2)上调的差异表达基因在生物功能方面主要富集于细胞氧化应激反应、成纤维细胞增殖的负调控、血细胞的生成、铁离子稳态等过程;在细胞组分方面主要富集于细胞质基质、细胞膜、内质网等部位;在分子功能方面主要富集于氧结合、亚铁结合、泛素蛋白连接酶结合等过程;主要涉及泛素介导的蛋白水解、HIF-1信号转导、内质网蛋白质加工等信号通路。下调的差异表达基因具有细胞内信号转导、m RNA的加工、蛋白质磷酸化等生物功能;主要富集于细胞核、细胞质、细胞膜等部位;主要具有蛋白质的结合、RNA的结合、蛋白激酶激活等分子功能;主要涉及内质网蛋白质的加工、白细胞经内皮的迁移、Rap1信号转导等信号通路。(3)利用STRING数据库对富集于生物功能的上调差异表达基因进行蛋白-蛋白互作网络分析,利用Cytoscape平台的Cyto Hubba插件筛选出FOXO3、SOD2、RUNX3、FECH、PRDX2等关键基因,其中FOXO3在关键基因中起到枢纽作用。(4)与健康对照组相比,CKD4-5期患者血清FOXO3水平升高,其中CKD5期最高,差异具有统计学意义(P<0.001)。(5)CKD 3组间TC、TG、HDL-C、LDL-C、UA的差异无统计学意义(P>0.05);CKD3-5期患者Hb、eGFR随着肾功能的恶化逐渐下降(P<0.001);Scr、BUN、Cys-C水平则随着肾功能的恶化逐渐升高(P<0.001);CKD4-5期患者ALB水平低于CKD3期患者(P<0.05),CKD4-5期之间ALB差异没有统计学意义(P>0.05);CKD5期患者血Ca低于CKD3期患者(P<0.05),CKD4期患者血P水平高于CKD3期患者(P<0.001),CKD4-5期患者之间Ca、P的水平则无统计学差异(P>0.05)。(6)FOXO3与Scr、BUN、Cys-C呈正相关(P<0.05),与Hb、eGFR负相关(P<0.05),与年龄、性别、BMI、ALB、TC、TG、HDL-C、LDL-C、UA、Ca、P没有相关性(P(29)0.05)。多元线性回归分析FOXO3与eGFR独立相关(P<0.001)。结论:本研究发现CKD3-5期患者血清FOXO3水平逐渐升高,与患者的肾小球滤过率呈负相关,表明FOXO3在CKD的进展过程中可能发挥一定的作用。
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