“十四五”规划将创新驱动发展作为未来的发展目标,强调了创新体系优化和区域协调发展的重大意义。然而,在现实发展中,我国正面临“卡脖子”技术攻关与创新体制机制改革的双向瓶颈,创新能力不适应高质量发展要求。而粤港澳大湾区作为我国建设国际科技创新中心的重要空间载体,存在着区域协同创新发展蓝图与跨区域协同治理之间的矛盾。基于此,本文采用CRITIC-熵权法、耦合协调发展模型、社会网络分析和地理探测器等方法,剖析区域创新生态系统耦合协调的复合演化趋势及网络结构特征,并从驱动因素出发进行分析,讨论促使区域创新良性共振、多中心一体化发展的有效建议。应国家之所需,解决区域创新协调发展的优化问题及动力机制问题,为粤港澳大湾区打造“双循环”的强战略支撑点,建设国际创新中心提供强有力的理论支撑和学术支持。本文通过提出四个机制假设和构建理论机理来诠释区域创新生态系统耦合协调的作用机制,对城市群进行深入细致的空间解构,主要包括以下内容:（1）通过区域创新生态系统协同发展的时序演化、空间格局分析,以及双重叠加耦合协调度与相对发展度的计算结果,发现创新活度与创新生境良性适配,耦合协调发展呈现以“广深港澳科技创新走廊”为脊向四围辐射扩散的空间格局,各城市的复合演进趋势存在显著的空间异质性。在2019年中美贸易摩擦的外部冲击下,大湾区的耦合协调发展首次受阻,但也借此深化了产业结构的创新转型,大部分城市迈入同步发展阶段。（2）突破变异系数、基尼系数等传统指标只能测度区域创新生态系统整体关联程度的局限性,深入探究区域创新生态系统内部耦合协调的动态网络空间结构,揭示区域创新的“黑箱”系统。研究发现,广州、深圳、香港的中心度均较为突出,具有最强的网络影响力。而在2010年就处于同步发展阶段的珠海,两类中心度在10年来显著提高。区域创新生态网络的整体空间关联日益密切,“核心-半核心-边缘”结构明显,在面对冲击时,区域创新生态网络展现出鲁棒性与脆弱性的双重特征。（3）基于区域创新生态系统内在自组织驱动机制,运用地理探测器模型揭示粤港澳大湾区创新协调发展驱动因子的协同或拮抗作用。结果显示,6个维度皆能显著地促进耦合协调发展,且交互作用后的双因子影响力显著提升。其中,创新活度类因子对耦合协调发展表现出更强的解释力,人均公共财政收入能较好地辅助多元因素发挥作用。耦合协调驱动效果在区域创新生态系统的发展周期与发展阶段上看存在动态演变性。基于上述分析得到政策启示为:（1）从深化协同创新发展路径来看,需培育优势创新群落,延伸创新食物链,完善区域创新生态系统的功能结构,提高整体系统的开放性与活跃度。（2）从整体区域的平衡性发展来看,需根据城市异质性协调特征因地制宜地制定发展战略,通过互补性分工协作强化整体网络的结构韧性,以交通基础设施“强联系”搭配政策体制“软对接”推进区域创新生态系统的协调发展。（3）从区域协调创新的动力机制来看,应把握创新活度的内源驱动机制,加强政策协同治理,引导多元因素合理配置、优质协调、高效凝聚,促使创新活度和创新生境高效融合与良性共振。