深部浸润型内异症血清CA-125水平分析和基于转录组数据的相关基因研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fyf7228912
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背景:子宫内膜异位症(Endometriosis,EMs)的发生具遗传因素,当前仍无较准确的早期无创性诊断方法。血清糖类抗原125(Cancer Antigen 125,CA-125)是一种临床应用提示EMs的生物学标志物,目前对其影响因素的研究仍不充分。尽管不同亚型的EMs是否具有一致的发病机制尚有争议,部分先前的研究还并未细化至具体的EMs亚型,包括浅表型,卵巢异位型(Ovarian Endometrioma,OMA),深部浸润型(Deep Infiltrating Endometriosis,DIE),进行不同亚型相关基因的探究。目的:分析DIE亚型CA-125的水平及其相关影响因素,包括初次确诊时的年龄、rASRM(the revised American Society for Reproductive Medicine)分期、EMs 病灶位置等。探究DIE亚型及DIE与OMA亚型共享的EMs发生进展相关基因及通路。方法:第一部分是一项回顾性研究,涉及63例DIE和63例OMA,采集数据包括患者初次确诊时的年龄,子宫肌瘤及子宫腺肌症两种EMs常见合并症的患病情况,既往生育史,rASRM分期,至少停药3个月后的腹腔镜手术前患者非月经期血清CA-125水平,术中所见的EMs病灶位置。比较DIE亚型与OMA亚型的临床特征差异,建立二元多变量逻辑模型(结局指标CA-125升高的定义为≥ 35 U/mL),以探究纳入的因素是否影响EMs患者血清CA-125水平。第二部分,利用采集8例DIE患者的在位和异位内膜样本,使用Illuminanova pe150测序后,用DESeq2分析所得的差异表达基因(Differential Expression Genes,DEGs),分析富集通路及功能模块。使用实时定量逆转录聚合酶链反应(Reverse Transcription Quantitative Rea-time-Polymerase Chain Reaction,RT-qPCR),测定 C1S,C1QC,C1QB在位异位子宫内膜组织mRNA的表达水平进行验证。第三部分,下载GEO数据库的系列GSE7305,GSE25628,GSE23339,分析时使用数据集中标注为在位子宫内膜或非EMs对照样本,及异位子宫内膜样本的数据,筛选DEGs,将上述三个数据集及DIE的DEGs通路功能富集,绘制DEGs蛋白互作网络,进行分子复合物检测(Molecular Complex Detection,MCODE)分析热点基因,将上述三个数据集及DIE的DEGs上传至Metascape进行多基因列表功能荟萃分析。结果:1.DIE组子宫肌瘤或子宫腺肌症的合并率比OMA组更高(子宫肌瘤合并率:OMA组及DIE组分别为0.0%和14.3%,P=0.003;子宫腺肌症合并率:OMA组及DIE组分别为3.2%和22.2%,P=0.002)。2.与40-62岁组相比,19-29岁年龄组患者非月经期血清CA-125升高至≥35 U/mL有显著性差异(OR,3.492;95%CI,1.202-10.144;Waldχ2=5.279;P=0.022);与rASRM Ⅲ期相比,rASRM Ⅳ期非月经期血清CA-125升高至≥35 U/mL具统计学意义(ref=rASRM Ⅲ期;OR,2.869;95%CI,1.284-6.410;Waldχ2=6.601;P=0.010)。3.DIE组中EMs累及韧带组的患者血清CA-125水平呈现出高于韧带未受累EMs患者的趋势(71.9±58.2 U/mL vs 50.9±39.0 U/mL)。4.补体激活相关通路在DIE数据集DEGs富集中呈现统计学差异,涉及基因包括C3,CLU,C7,C4BPA,C1S,SERPING1,C4B,PROS1,C1R,C1QC,C1QB 等。5.涉及DIE和OMA两种亚型的四个数据集共享的MCODE核心DEGs为C3,PNOC,MYH11,MYL9,GPC3。DIE及OMA亚型共享的DEGs富集的GO功能模块包括,循环系统过程(GO:0003013),白细胞迁移(GO:0050900),急性炎症反应(GO:0002526),血管发生(GO:0001568),胚胎形态学发育(GO:0048598)等。结论:1.DIE亚型可能比OMA亚型更常见合并子宫肌瘤或子宫腺肌症;2.EMs患者非月经期血清CA125的水平可能不受EMs异位病灶位置的影响;3.DIE及OMA患者的非月经期血清CA-125水平可能受年龄及rASRM分期影响;4.补体激活相关途径可能参与DIE亚型的发生进展;5.C3,PNOC,MYH11,MYL9,GPC3可能参与调控了 DIE和OMA两种亚型EMs的病理学过程。
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