在细胞存活和发育中,关键蛋白质起着不可或缺的作用,可用生物学实验方法和计算方法识别关键蛋白质,前者的优点是能够准确识别关键蛋白质,但是其不足之处是存在耗时、昂贵且效率低下等;后者的优点是能够快速识别关键蛋白质。为了克服生物实验方法的缺点,许多计算方法先后被提出,这些方法基本可以分为两类:基于拓扑的计算方法和融合蛋白质生物信息的计算方法。前者使用蛋白质相互作用网络的拓扑特征,后者使用融合蛋白质复合物等多数据源来识别关键蛋白质。由于蛋白质相互作用数据不完善等原因,导致现有的关键蛋白质识别方法准确率较低,因此如何提高识别精度,仍是具有挑战性的工作。本文基于蛋白质相互作用网络的拓扑特性,融合蛋白质生物信息,提出识别关键蛋白质的PSHC、PSLC有效方法。PSHC是一种基于结构洞理论和蛋白质复合物信息,提出的多数据源融合关键蛋白识别方法。首先,PSHC方法首次把结构洞理论引入到了关键蛋白质识别方法中;其次,融合了蛋白质相互作用网络和蛋白质复合物两种数据源用于识别关键蛋白质。在DIP和Krogan两个蛋白质数据集上的实验结果表明,与其他传统方法相比,PSHC方法可以识别更多关键蛋白质,识别准确率更高,并且灵敏度、特异性、准确性、阳性预测值、阴性预测值、F测度等统计指标也明显高于其他方法。因此将结构洞和蛋白质复合物信息相结合的关键蛋白质识别方法是有效的。PSLC是一种基于亚细胞定位、蛋白质复合物和蛋白质相互作用网络,提出的多数据源融合关键蛋白质识别方法。PSLC方法不仅考虑了蛋白质复合物内度的情况,还考虑了蛋白质复合物外度的情况;其次,融合了亚细胞定位信息来评价蛋白质的重要性。在DIP和Krogan两个蛋白质数据集上的实验结果表明,与其他传统方法相比,PSLC方法可以识别更多关键蛋白质,并且灵敏度、特异性、准确性、阳性预测值、阴性预测值、F测度等统计指标也明显高于其他方法。