转座子介导的斑马鱼增强子捕获研究

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增强子捕获技术是一种依据报告基因在转基因品系中呈现的组织或细胞特异性表达来鉴定未被注释基因表达模式的方法。尽管已有一些增强子捕获载体被运用到斑马鱼中,并获得大量在不同组织或细胞类型特异表达报告基因的转基因品系,但是由于基因组中增强子对捕获载体中弱启动子的调控存在偏好性,仍然需要对载体元件加以改进,以提高增强子捕获载体的特异性和效率。为此,我们构建了一个新的增强子捕获载体pTME,主要由小鼠金属硫蛋白基因(mMTI)的弱启动子和其调控的EGFP报告基因构成。通过启动子活性分析发现,在候选的四个弱启动子(mMTI,CMV, SV40和截短的EF1α启动子)中,mMTI启动子具有最低的转录活性。在第一轮的增强子捕获筛选中,我们获得了12个EGFP在特定组织或细胞中呈现特异表达的转基因斑马鱼品系。在品系pTME1、pTME3和pTME9中,EGFP的表达模式分别与距离插入位点最近基因tcf7l2,hs3st3b1b和mecom的表达模式相似。另外,我们在pTME载体中引入一个插入突变元件,该元件在一个EGFP泛表达的品系中可以有效阻断内源基因的表达。通过对品系pTME12的分析,在位于捕获元件插入位点附近,我们发现一段高度保守的非编码序列,该序列具有调控EGFP在中枢神经系统特异表达的增强子功能。因此,pTME载体可有效用于增强子捕获和突变体筛选。  MicroRNA-9(miR-9)可在脊椎动物中枢神经系统中特异表达,其序列在物种间高度保守,因而其在被发现后就获得神经生物学家的关注。然而,尚未有研究对表达miR-9的细胞在斑马鱼胚胎发育期和成鱼期的分布进行精确定位。应用增强子捕获技术,我们得到了报告基因EGFP在中枢神经系统中特异表达的转基因品系pTME12。进一步分析表明,在48 hpf幼苗的脊索中,大部分EGFP标记的细胞为放射状胶质细胞,而在96 hpf视网膜中的EGFP标记细胞为Müller胶质细胞。在成鱼期,EGFP依然在视网膜的Müller胶质细胞中表达,并在成鱼大脑的神经增殖区富集。插入位点分析表明,捕获元件位于一个长片段非编码RNA(miR-9-6-OT1)下游的4.5kb处,且EGFP的分布与内源miR-9-6-OT1的表达图式高度一致。此外,miR-9-6-OT1的第一个外显子包含一个编码miR-9的前体基因miR-9-6,且在斑马鱼中miR-9-6-OT1与早期报道的miR-9的表达图式一致。因此,增强子捕获品系pTME12中表达的EGFP很好地模拟了内源miR-9-6的表达,因此该品系可用于确定表达miR-9的细胞和研究miR-9的活体功能。
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