我国社会经济表现出的强劲势头和经济体制的变革,在一定程度上促进着我国企业的日益壮大和多元化经营;企业重组也逐渐发展成为企业快速成长的一种有效方式。资本市场的重组中,也吸引着越来越多的自然人股东,我国的自然人股东参与企业重组的所得税政策并不完善,导致同一重组行为中企业法人股东与自然人股东的税收待遇失衡,形成了诸多因为自然人股东无法承担参与企业重组所形成的个人所得税而导致重组失败的案例。2019年1月1号实行的最新个人所得税政策对于自然人股东参与企业重组行为的个人所得税相关问题并未作出调整,自然人股东在“不公平”政策的影响下仍然不能积极的参与市场经济活动。个人所得税政策的改良完善已经成为自然人股东参与重组经济活动的重要保障和前提。本文主要对自然人股东股权转让和以非货币性资产投资参与企业重组行为的税收政策进行深入研究,分析政策的演变过程,通过国投中鲁的重大资产重组案例进行深入挖掘,对企业重组失败的原因进行分析,列举现行个人所得税政策的缺陷总结政策缺陷带来的不好影响。结合国外的实践经验进行分析,从税收待遇、相关规定、征收管理等方面提出优化建议,改善我国自然人股东参与企业重组的环境,充分利用市场的资源,促进经济发展。