【摘 要】
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目的:本研究旨在筛选子宫内膜异位症（简称内异症）的差异基因,筛选内异症合并不孕的差异基因,探究共同差异基因的功能,寻找关键基因（hub gene）,从而为临床诊断提供可能的生物标志物（Biomaker）,为深入理解内异症合并不孕的分子机制提供新思路。方法:1.以“Endometriosis”为关键词在GEO（Gene Expression Omnibus）数据库中检索表达谱芯片数据,选取:人类组织
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目的:本研究旨在筛选子宫内膜异位症（简称内异症）的差异基因,筛选内异症合并不孕的差异基因,探究共同差异基因的功能,寻找关键基因（hub gene）,从而为临床诊断提供可能的生物标志物（Biomaker）,为深入理解内异症合并不孕的分子机制提供新思路。方法:1.以“Endometriosis”为关键词在GEO（Gene Expression Omnibus）数据库中检索表达谱芯片数据,选取:人类组织来源的;全基因组RNA表达的芯片;正常人群（未患不孕症）中患及不患子宫内膜异位症的配对芯片;内异症人群中患及不患不孕症的配对芯片。2.在R语言（The R Project for Statistical Computing）中分析计算,以差异倍数（|log2（Fold Change）|＞1）和显著水平（Pvalue＜0.05）为标准,筛选正常人群（未患不孕症）中,患与不患内异症的2个群体的差异基因集,即可能导致正常人群患内异症的基因集;筛选患内异症的人群中,患与不患不孕症的2个群体的差异基因集,即可能导致内异症患者合并不孕的基因集。将上述2个差异基因集取交集,得到共同差异基因集,即既可能致正常人患子宫内膜异位症、又可能致内异症患者合并不孕的基因集。3.对共同差异基因集进行GO本体功能富集分析和KEGG生物通路富集分析。4.将所得基因集经由String数据库以构建PPI网络（蛋白质-蛋白质相互作用网络）,通过Cytoscape软件利用cyto Hubba插件以筛选关键基因。结果:1.得出共同的差异基因共有71个,其中11个差异基因的表达基本呈上调趋势,60个差异基因的表达基本呈下调趋势。2.GO功能注释分析显示:差异基因在生物过程中主要富集在肌动蛋白丝组织、肌动球蛋白结构组织、子宫内胚胎发育、L-谷氨酰胺跨膜转运正调控、T细胞增殖;在细胞组分中主要富集在胞吞泡、内吞泡腔、内质网腔、晚期胞内体、晚期内体膜;在分子功能主要富集在肌动蛋白结合、碳水化合物结合、结合珠蛋白结合、单糖结合、转移烷基或芳基（甲基除外）的转移酶活性。3.KEGG通路分析显示差异基因主要富集在4条信号通路上,主要为致病性大肠杆菌感染信号通路、吞噬小体信号通路、内质网中的蛋白质加工信号通路、细胞粘附分子通路。4.利用String数据库构建了PPI网络,经由Cytoscape软件利用Cyto Hubba插件通过Degree算法计算关键基因,提示MATN3、APOE、VCAN、PDIA6、SCG2、GOLM1、HSP90B1、GRN、TUBB、ITGB1最有可能充当关键基因。结论:MATN3、APOE、VCAN、PDIA6、SCG2、GOLM1、HSP90B1、GRN、TUBB、ITGB1最有可能充当关键基因,可能在子宫内膜异位症疾病的发生及导致内异症患者合并不孕的发生中发挥重要作用,有可能成为临床疾病诊断的生物标志物。
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