【目的】N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine,m~6A）作为哺乳动物最普遍的RNA的修饰方式,在RNA的转录、剪接、稳定性以及翻译等生物学过程中起重要作用。长链非编码RNA（long non-coding RNA,lnc RNA）是一类长度在200nt以上的非编码RNA,能够作为m~6A的重要修饰分子,通过包括染色质修饰以及直接的转录调控等多种方式发挥着重要功能。m~6A及lnc RNA的交互在肿瘤发生发展中扮演着关键角色,然而目前缺乏在泛癌水平上全面识别m~6A相关lnc RNA并对其功能进行解析的系统性研究。因此本课题通过整合泛癌转录组数据与实验支持的m~6A修饰信息,系统地识别人类肿瘤中m~6A相关的lnc RNA,并从竞争性内源RNA（competitive endogenous RNA,ce RNA）网络、药物敏感性分析以及生存分析等多角度出发,对m~6A相关lnc RNA的功能进行解析。【方法】本课题通过整合癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）收录的33种癌症转录组数据以及m6A2Target与m6A-Atlas数据库中获取的m~6A修饰位点信息,利用Pearson相关方法探究候选lnc RNA与m~6A调控子之间的表达关联,在泛癌层面系统识别了m~6A相关的lnc RNA。下一步,收集实验支持的mi RNA与其靶基因的互作信息,基于泛癌转录组数据构建m~6A相关lnc RNA介导的ce RNA网络,通过对网络中的编码基因进行富集分析以此探究lnc RNA的功能。接下来,从癌症药物敏感性基因组学（genomics of drug sensitivity in cancer,GDSC）数据库中下载癌症细胞系相关的药物处理数据,基于基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis,GSEA）理论探讨m~6A相关lnc RNA与药物敏感性之间的关联。最终,基于m~6A相关lnc RNA的表达中值进行生存分析,探究其对于癌症患者预后的影响。【结果】本研究在33种癌症类型中识别到5877个m~6A相关lnc RNA,发现m~6A对于lnc RNA的修饰在泛癌中普遍存在,同时也发现了大量lnc RNA与m~6A调控子呈正相关关系。此外,在泛癌层面识别到356个癌症保守与744个癌症特异的m~6A相关lnc RNA,发现癌症特异的lnc RNA与组织特异性相关,癌症保守的lnc RNA在癌症相关生物学功能中是保守的。在对lnc RNA介导的ce RNA网络、药物敏感性分析以及预后分析的基础上,开发了一个m~6A相关lnc RNA的集成资源平台Lnc2m6A（http://hainmu-biobigdata.com/Lnc2m6A）,提供了多种浏览、查询m~6A相关lnc RNA功能的选项,用于展示lnc RNA与m~6A之间的关系以及相关lnc RNA的功能。通过对该数据库的应用,观察到lnc RNA FGD5-AS1在泛癌层面中与大量的m~6A调控子关联并发挥重要功能,并且其表达与乳腺癌的顺铂耐药以及亚型预后相关。此外,m~6A相关的lnc RNA DANCR在低级胶质瘤（Brain Lower Grade Glioma,LGG）中与多个神经肿瘤及发育基因存在竞争关系,并在患者生存中作为风险因素。【结论】综上,本文通过整合人类癌症转录组数据及m~6A修饰数据,系统刻画了m~6A相关的lnc RNA全局景观。以ce RNA,药物敏感性以及生存分析为基础构建的Lnc2m6A数据资源能够提供准确的肿瘤表观治疗靶点,该项目的完成将成为相关研究人员探究m~6A修饰lnc RNA功能的一大利器,同时也为揭示肿瘤表观调控机制,确定有效的癌症治疗标志物等提供新思路。