背景及目的细菌性痢疾（简称菌痢）是由志贺菌引起的肠道传染病,是我国法定乙类传染病之一,是全世界范围内流行的最常见腹泻性疾病之一。近年来广西菌痢防控和监测工作趋于弱化,与此同时,在一些卫生条件较差的幼托机构、农村寄宿制学校和村镇不时有由于自备水源受污染引起的菌痢疫情暴发,而有关菌痢的流行强度、三间分布、暴发疫情特征等方面的研究报道较少。宋内志贺菌有逐渐取代福氏志贺菌成为引起菌痢的主要病原菌的趋势,而广西缺少从基因水平对菌株耐药等病原学特征的进一步研究。基于这一现状,本课题开展对2011～2019年广西菌痢流行病学特征和宋内志贺菌病原学特征的研究,为有效防控菌痢、科学开展菌痢监测、指导临床合理用药、控制耐药性的传播提供科学依据。方法1.从中国疾病预防控制信息系统检索下载数据,采用描述性流行病学方法对广西2011～2019年报告的菌痢病例及暴发疫情进行回顾性分析。2.使用VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统对宋内志贺菌分离株进行系统的生化反应再鉴定;对确认的宋内志贺菌采用微量肉汤稀释法进行药物敏感试验。3.合成特异性引物,采用PCR方法和毛细管电泳方法对菌株携带相关耐药基因进行检测分析。4.使用Seq Man软件对菌株blaCTX-M基因核苷酸序列进行拼接,NCBI网站上进行BLAST比对,使用MEGA 7软件,采用近邻相接法构建系统进化树,分析菌株blaCTX-M基因在blaCTX-M簇群中的亲缘关系。结果1.2011～2019年广西累计报告菌痢病例29 369例,年均报告发病率6.85/10万;年均发病率居前3位的地市依次是贺州市（25.08/10万）、河池市（12.52/10万）和梧州市（11.39/10万）;病例主要集中在5～10月,占报告病例总数的61.92%（18 186/29 369）;男女平均发病率分别为7.38/10万、6.29/10万,发病率性别比为1.17:1;各年龄段均有病例发生,年龄最小的病例为出生3天,年龄最大的病例为96岁,0～6岁儿童病例占病例总数的60.30%。2.2011～2019年广西共报告菌痢暴发疫情16起,发病人数1 039例,罹患率为5.47%;暴发于9～11月的占68.75%（11/16）,尤以9月最多（6/11）,;暴发于幼儿园和中小学的疫情合计占总数75.00%（12/16）;暴发疫情主要为水源性传播,占75.00%（12/16）;81.25%（13/16）由宋内志贺菌引起。3.广西宋内志贺菌对治疗菌痢的首选药物环丙沙星的敏感率为86.67%,中介率为13.33%,无耐药现象;对治疗菌痢的二线药物头孢曲松的耐药率为96.67%,敏感率为3.33%;对用于成人菌痢治疗药物阿奇霉素的耐药率为96.67%,敏感率为3.33%;多重耐药率为98.89%。4.广西宋内志贺菌blaCTX-M-9群基因检出率为55.56%,经系统发育分析均为blaCTX-M-14亚型;blaTEM基因检出率为1.11%,未检出blaCTX-M-1group、blaCTX-M-2/8/25 group和blaNDM等其他β-内酰胺酶基因。质粒介导的喹诺酮耐药基因qnr A、qnr B检出率均为1.11%。mph（A）基因检出率为87.78%,未携带mph（A）基因的宋内志贺菌多为敏感株,携带mph（A）基因的耐药株的MIC值普遍比未携带mph（A）基因的耐药株的MIC值高,耐药程度更高。整合子IntⅠ1基因、Int I2基因和hep74/51基因盒检出率分别为47.48%、60.00%和46.67%。结论1.2011~2019年广西菌痢发病率总体呈下降趋势,维持在较低水平;各地市发病率差异较大,高发地区集中在广西东部和北部;发病的季节性已不明显;发病高危人群是低龄儿童、农民和学生。2.2011~2019年广西菌痢疫情暴发时间集中于9~11月;幼儿园和中小学为高发场所;以水源性传播为主;宋内志贺菌成为暴发疫情的优势病原菌,且有进一步上升的趋势。3.广西宋内志贺菌多重耐药现象严重,对大多数抗菌药物的耐药性稳定,但不排除随时间推移而变迁的可能。4.广西宋内志贺菌普遍携带有相关耐药基因,携带mph（A）基因与菌株对阿奇霉素耐药有较大的关联,携带单一型别的ESBLs编码基因与菌株对β-内酰胺类药物耐药没有明显的关联。