基于单细胞转录组学测序的脓毒症免疫抑制分子通路的研究

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研究背景脓毒症是高发病率、高死亡率、治疗费用昂贵的急危重症疾病。免疫抑制是脓毒症发展至后期的特征之一,这主要与T淋巴细胞数量耗竭及T淋巴细胞受体多样性的降低有关。目前与T淋巴细胞相关的改善脓毒症免疫抑制的方法有很多,但具体治疗机理及效果尚未完全明确,脓毒症免疫抑制期间T细胞受体表达受抑制的分子与通路间相互作用的机制仍未明了。因此,本研究通过单细胞转录组学测序技术(scRNA-seq)进行多组学数据整合,在分子及通路水平初步探讨脓毒症T细胞受体表达受抑制的调控机制,为脓毒症的免疫治疗提供新策略。研究目的基于单细胞转录组学测序技术(scRNA-seq)进行多组学数据整合,探究脓毒症T淋巴细胞受体表达受抑制过程中分子与通路间相互作用的机制,初步预测脓毒症免疫治疗的分子生物学靶点。研究方法本研究将4名脓毒症患者和4名健康对照者的单细胞转录组测序数据进行比对、校正,使用R软件(版本3.5.1)进行统计分析与可视化,对健康对照组与脓毒症组中所检测到的细胞进行数量统计与分群,通过对细胞亚群之间差异基因表达丰度进行比较,分出细胞簇,并根据经典单细胞参考数据集,推断细胞的类型。找出与脓毒症免疫抑制显著相关的T细胞与T细胞特异性表达的细胞簇类型,并将以上信息比对到脓毒症组与健康对照组上,最终找出健康对照组与脓毒症组特异性对应的细胞簇类型。将健康对照组与脓毒症组中具有差异表达基因的信号通路进行对比,进一步找出该生物学信号通路上显著差异表达的转录分子,进而阐述脓毒症免疫抑制状态下该转录相关分子与生物学信号通路在疾病中相互作用的关系。研究结果本试验将收集到的4名脓毒症患者和4名健康对照者的血液样本(5mL)进行单细胞转录组测序,并基于单细胞转录组数据整合的多组学数据进行比对分析,应用于脓毒症免疫抑制机制分子水平层面的研究,结果表明:(1)脓毒症的免疫抑制与T细胞数量大幅度减少及T细胞受体(TCR)多样性明显下降相关。(2)脓毒症中T细胞受体信号通路受到抑制。(3)脓毒症患者中核转录因子E2F2显著活跃。(4)转录因子E2F2可能通过阻碍T细胞受体信号通路,抑制T细胞受体的表达,影响T细胞的免疫应答,进而参与脓毒症的免疫抑制过程。研究结论抑制E2F2转录因子的表达,可能会促进T细胞受体信号通路的转导,增加T细胞表面受体的表达,加强T细胞免疫应答,可改善脓毒症的免疫抑制状态,为今后脓毒症的免疫治疗提供潜在分子靶点及新思路。
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