本论文采用电喷雾电离串联质谱技术结合高分辨质谱技术、氢氘交换实验和理论模拟计算的方法系统地对4,5-吲哚-1,2,4-三氮唑-3-酮衍生物和环状吲哚基α-氨基酯衍生物这两类吲哚功能分子的气相质谱裂解反应机理进行研究,探索其质谱裂解反应中的气相“H/D scrambling”现象、溶剂化效应以及离子/中性复合物等重要内容。首先,对质子化4,5-吲哚-1,2,4-三氮唑-3-酮衍生物的断裂反应是否存在气相“H/D scrambling”现象进行了研究。研究表明,该类化合物的质子化离子高能量碰撞解离产生两种质量互补的碎片离子:质子化的3-（亚肼基亚甲基）-吲哚衍生物（碎片离子a）和质子化的3-异氰酸基-1-甲基吲哚衍生物（碎片离子b）。在氢氘交换（HDX）实验中除了观察到相应的活泼氢全氘代的碎片离子a-d₃和b-d₁外,还观察到了一个活泼氢氘代的碎片离子a-d₁、两个活泼氢氘代的碎片离子a-d₂和未被氘代的碎片离子b。由密度泛函理论计算可知,N¹和O¹³是该类化合物可能的质子化位点,外加质子从N¹迁移到C⁷或C⁹位点上和外加质子从O¹³迁移到C¹⁰、C¹²和N²位点上的过渡态能垒低于该类化合物裂解的过渡态能垒,表明在裂解前,N¹和O¹³上的外加质子可以分别与C⁷或C⁹和C¹⁰、C¹²或N²上的质子发生可逆的分子内质子交换反应,导致在HDX实验中出现“H/D scrambling”现象,进而产生碎片离子a-d₁、a-d₂和b。其次,论文对环状吲哚基α-氨基酯衍生的质子化离子在Q/Orbitrap质谱仪和QTOF质谱仪上的裂解反应及其加合锂离子在Q/Orbitrap质谱仪上的裂解反应进行了研究。研究表明,环状吲哚基α-氨基酯衍生物的质子化离子在Q/Orbitrap质谱上HCD解离,由于碎片离子在C型离子阱中的驻留时间足够长,除了发生离子中性复合物介导的质子转移反应,还与碰撞池中的残留水发生H/D交换反应,产生气相“H/D scrambling”现象;另外,由于锂离子的配位作用,其加合锂离子HCD解离,产生的碎片离子和残留水分子形成稳定的复合离子,在氢氘交换实验中没有观察到气相“H/D scrambling”现象。此外,由于QTOF质谱仪和Q/Orbitrap质谱仪构造不同,环状吲哚基α-氨基酯衍生物的质子化离子在QTOF质谱仪上碰撞诱导解离产生的离子/中性复合物介导的裂解反应与其在Q/Orbitrap质谱仪上的不同,在氢氘交换实验中也没有观察到气相“H/D scrambling”现象。