水稻作为一种重要的粮食作物,同时也是一种重要的模式生物,对它的研究始终是生命科学研究领域的一大热门。近年来,代谢组学研究方法发展迅速,已在很大程度上被运用于植物学乃至水稻研究之中。代谢组学样品处理环节被视为代谢组学研究最大关键因素之一,提取方法的不同对研究结果影响较大。本课题旨在评估不同提取方法对水稻种子代谢组学研究的影响,并讨论提取方法选择策略。我们选择了植物代谢组学研究中最为常见的三种提取液:1)超纯水:乙腈:异丙醇=2:3:3(体积比);2)超纯水:甲醇=2:8(体积比);3)甲醇:氯仿:超纯水=4:5:3(体积比),对扬稻6号及武运粳7号两种水稻品种成熟种子样品进行非靶标的代谢组学轮廓分析。超高效液相色谱质谱联用在水稻种子样品中共鉴定出已知代谢物165种,其中初级代谢产物122种,次生代谢产物43种。检测结果表明:不同的提取方法对两种水稻种子代谢物的检出覆盖率及得率均有显著的影响,不同的提取方法还影响两到种水稻种子代谢组差异性的比较。分析结果表明,提取方法三在检出覆盖率和得率上都有优势,但选择提取液三意味着两倍的检测分析工作量,适合对广度精度要求高的水稻种子研究。提取方法二在单次操作的前提下覆盖率和得率均较为可观,效率较高,适合水稻种子一般代谢组学的研究。本课题的研究结果为根据实验目的评估水稻种子代谢组学的研究提供了样品提取方法的依据。