lncHSAT164在乳腺癌中的功能特征研究

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研究背景:乳腺癌是一种危害全球女性健康的癌症,是全球女性癌症相关死亡的主要原因。五年患病率统计数据表明,全球约11%的乳腺癌发生在中国,并且近几十年来发病率不断增加。目前全基因组关联性研究(Genome-wide Association Studies,GWAS)及外显子组测序已被广泛用于鉴定疾病相关的易感基因/位置,并鉴定100个以上与乳腺癌相关的易感基因座,但是大多数与乳腺癌相关的变异体位于人类基因组的非编码区。长的非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍表达并报道与恶性肿瘤的形成和发展有关,lncRNA作为生物进程中的关键调节因子,在乳腺癌的发生发展过程中也发挥着关键的作用。随着乳腺癌lncRNA研究的深入,很多lncRNAs被鉴定为乳腺癌诊断治疗的潜在生物标记物,为乳腺癌的诊断治疗、预后评估及耐药等方面提供新的理论依据。基于本课题组先前的全基因组lncRNA相关性研究中鉴定了一个新的乳腺癌易感单核苷酸多态性位点rs11066150,并发现rs11066150定位于NONHSAT164009(lncHSAT164)转录本和NAA25(N(Alpha)-Acetyltransferase25,NAA25)基因第五号内含子上,在此我们主要针对NONHSAT164009(lncHSAT164)在乳腺癌中的功能展开一系列相关性研究。研究目的:基于本课题组先前的全基因组lncRNA相关性研究中鉴定的一个新的乳腺癌易感SNP位点rs11066150,定位于NONHSAT164009(lncHSAT164)转录本上。本研究通过5’和3’RACE实验确定lncHSAT164转录本全长,并通过一系列生物技术探究lncHSAT164在乳腺癌细胞系中的功能。旨在为乳腺癌的诊断治疗找到新的标记物,为后期乳腺癌的功能研究提供基础。研究方法:首先,我们通过5’和3’RACE实验确定lncHSAT164转录本全长序列。然后设计引物进行q RT-PCR检测lncHSAT164在乳腺癌组织中的表达。随后,设计并构建过表达载体在MCF7和T47D细胞系中对lncHSAT164进行过表达、设计si RNA在MCF7和T47D细胞中对lncHSAT164进行干扰。并且通过q RT-PCR、流式细胞技术、Northern blot、RNA-pull-down以及克隆形成实验等研究lncHSAT164在乳腺癌发生发展中的功能特征。实验结果:(一)lncHSAT164是一个长约1,700个核苷酸的转录物,在乳腺癌组织中高表达,在正常的乳腺细胞MCF10A和乳腺癌细胞MCF7、T47D之间我们也做了进一步的q RT-PCR分析,lncHSAT164在T47D细胞中高度表达。在MCF7和T47D细胞系中进行亚细胞定位显示,相对于细胞质lncHSAT164主要分布在细胞核中。(二)在乳腺癌细胞系MCF7和T47D中对lncHSAT164进行过表达和RNA干扰处理,进行流式细胞分析显示,lncHSAT164过表达可抑制乳腺癌细胞的凋亡,lncHSAT164表达的干扰则促进乳腺癌细胞的凋亡;lncHSAT164干扰后,乳腺癌细胞停留在G0/G1期的细胞减少,停留在G2/M期的细胞增多。(三)MCF7和T47D克隆形成实验结果显示,lncHSAT164过表达后,促进乳腺癌细胞的增殖;lncHSAT164经si RNA干扰后,可抑制乳腺癌细胞的增殖。(四)通过RNA-pull-down实验,不幸的是我们在本研究中暂时未得到与其结合的相关蛋白。结论:在我们研究中,lncHSAT164是一个长约1,700个核苷酸的转录物,相对于细胞质lncHSAT164主要分布在细胞核中。在乳腺癌组织中高表达,并且lncHSAT164的表达参与乳腺癌的发生发展,促进乳腺癌细胞的增殖,抑制乳腺癌细胞的凋亡并参与细胞周期的调控。在这里lncHSAT164可被认为乳腺癌相关的lncRNA,并可作为乳腺癌诊断治疗的一个新的潜在生物标记物,但是未得到与其结合的相关蛋白,在后期将对实验方案进一步改进展开相关研究。
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