长链非编码RNA LINC01936在NSCLC中作为抑癌基因的研究

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nmjhurfdv
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:肺癌是世界范围内最为常见的恶性肿瘤之一,其发病率和致死率在世界范围内均居于首位。依据组织病理学方法分型,肺癌病理类型可分为小细胞肺癌(SCLC)及非小细胞肺癌(NSCLC)。其中,NSCLC在所有肺癌中占85%左右,是最常见的肺癌类型。在当前阶段,手术治疗仍然是NSCLC患者的重要治疗方式,接受手术治疗的患者预后较佳。但由于NSCLC具有起病隐匿,初期症状不明显的特点,因此大部分患者第一次就诊时就处于疾病的中晚期。NSCLC的其他治疗方法还有放射治疗、化疗、靶向治疗及免疫治疗等,这些疗法可以部分延长NSCLC患者的生存时间,但是仍然存在并发症较多,患者容易出现耐药等问题。上述原因导致NSCLC患者整体预后较差,患者生存质量不甚理想。因此,为NSCLC的诊断和治疗寻找新的生物标志物以提高患者的早期诊断率、延长生存时间、提升生存质量,是NSCLC研究领域内的一项重要课题。长链非编码RNA(Lnc RNA)通常代指一类长度超过200个核苷酸、不具备蛋白质编码功能的新型RNA分子。研究表明,lnc RNA本身就是功能单位,可以在表观遗传水平、转录后和翻译水平上改变基因的表达,从而参与细胞内多种功能的调控。有研究指出,在肿瘤细胞内除了蛋白质编码基因的突变或异常表达外,lnc RNA的突变和异常表达在肿瘤发生发展过程中也起到了重要作用。近年来,有许多lnc RNA已经被证实在肿瘤生长和转移中具有关键的驱动作用,并且可以作为这些肿瘤早期诊断和精准治疗的生物标志物和治疗靶点。因此,从lnc RNAs内选取NSCLC的新型生物标志物和治疗靶点具有极强的前景。相关研究表明,长链非编码RNA01936(LINC01936)与肺腺癌(LUAD)患者的总生存期相关,可能在肺癌中起调控作用。然而,LINC01936在NSCLC中的表达量、功能和相关分子机制尚未被明确阐述。目的:本研究拟分析肿瘤基因图谱(TCGA)数据库内NSCLC患者的基因表达信息,使用生物信息学方法综合分析LINC01936在NSCLC中的作用。使用笔者随访及TCGA数据库内的临床病理资料,综合探究LINC01936和NSCLC患者临床病理资料的关联。使用NSCLC细胞系进行体外实验,探究LINC01936对NSCLC功能的影响。方法:1.在UCSC数据库下载NSCLC患者的RNA-seq数据和临床病理资料并进行标准化。使用生物信息学方法鉴定LINC01936在NSCLC中的表达,并分析LINC01936和临床病理资料的相关性。2.使用加权基因共表达网络分析法(WGCNA)分析TCGA数据集,鉴定LINC01936与NSCLC之间的相关性。使用基因集富集分析(GSEA)探究LINC01936在NSCLC部分可能发挥的功能及下游分子机制。3.采用定量逆转录聚合酶链反应(q RT-PCR)检测LINC01936在57对配对肺癌组织及癌旁正常组织中的表达,检测非小细胞肺癌细胞系(A549)中LINC01936基因的表达;构建LINC01936基因的过表达载体,构建LINC01936过表达细胞系;CCK-8试剂盒(CCK-8)测定LINC01936对NSCLC细胞增殖的影响;使用创伤愈合实验(wound healing assay)和Transwell实验检测LINC01936对NSCLC细胞迁移和侵袭能力的影响。结果:1.LINC01936在NSCLC组织中呈现低表达;且在TCGA数据集内LINC01936的表达量与患者预后显著相关。2.WGCNA结果表明,LINC01936所在的基因模块与NSCLC显著负相关,证明LINC01936在NSCLC中起抑癌作用。GSEA结果表明LINC01936在细胞内参与了多种功能的调控,如细胞因子结合、DNA构象改变等;同时LINC01936参与了细胞内多种信号通路的调控,如p53信号通路、JAK-STAT通路等。3.RT-qPCR结果显示,相较于癌旁组织,LINC01936在NSCLC组织中表达下调;且LINC01936的表达量与肿瘤T分期相关。4.细胞学研究显示LINC01936的过表达抑制了NSCLC细胞的增殖;创伤愈合实验和Transwell实验证明LINC01936的过表达可以抑制NSCLC细胞的迁移和侵袭能力。结论:LINC01936在NSCLC中低水平表达,高表达LINC01936的患者预后较好。LINC01936的过表达抑制了NSCLC细胞的生长、迁移和侵袭。因此,LINC01936在NSCLC中起抑癌作用,可能是一个潜在的NSCLC的诊断和治疗生物标志物。
其他文献
目的:本研究主要分析晚期上皮性卵巢癌肠道转移患者的手术治疗及预后。方法:本研究选取我院2015年1月至2020年12月期间Ⅲ-Ⅳ期上皮性卵巢癌肠道转移患者,进行回顾性分析。入组患者共255例,根据手术治疗方式分为2组,分别为研究组101例和对照组154例,研究组即转移肠段切除术治疗,对照组即肠道转移肿瘤剥除术治疗。收集的数据包括年龄、手术方式、手术时间、组织学、分期、住院时间、新辅助化疗周期、复发
学位
预处理是木质纤维原料以糖基平台为基础的生物炼制的关键步骤,在对目前常用的稀酸/碱、蒸汽爆破、高温热水、微波、亚临界CO2、离子液体、低共熔溶剂、有机溶剂、研磨/粉碎、生物预处理等方法的优缺点及对后续酶解发酵研究进展进行综述的基础上,介绍了国内外基于Aspen Plus流程模拟和技术经济分析等在生物质原料经预处理联产乙醇和平台化学品的利用情况,最后总结了Aspen Plus计算机模拟技术在生物质原料
期刊
近年来乳腺癌发病率逐渐上升,因其存在高度的肿瘤异质性而预后情况不同。肿瘤免疫微环境在肿瘤的发生和发展中起着关键作用,其中肿瘤抗原的定量指标肿瘤突变负荷(Tumor mutation burden,TMB)在乳腺癌中发挥的作用显得越来越重要。同时随着免疫治疗在乳腺癌中的广泛应用,PD-L1同样也成为关注的热点话题。本研究分为两部分,第一部分分析乳腺癌中TMB与肿瘤免疫相关基因和肿瘤微环境中免疫细胞对
学位
目的:回顾性分析程序性死亡受体-1(Programmed cell death receptor 1,PD-1)或程序性死亡分子配体-1(Programmed cell death ligand 1,PD-L1)抑制剂联合靶向药物在我院住院的晚期肝癌患者中的临床疗效及安全性,进一步为晚期肝癌患者探索有效安全的治疗方法。方法:收集2018年1月1日至2022年1月20日于河北医科大学第四医院住院并接
学位
目的:惰性淋巴瘤是淋巴瘤中临床病程缓慢,侵袭程度较低的一类淋巴瘤,约占非霍奇金淋巴瘤的40%。边缘区淋巴瘤(marginal zone lymphoma,MZL)是第二常见的惰性淋巴瘤,可分为粘膜相关淋巴组织(mucosa-associated lymphoid tissue,MALT)淋巴瘤、淋巴结MZL及脾MZL,其中原发于淋巴结或脾脏以外的边缘区淋巴瘤为原发性黏膜相关淋巴组织结外边缘区淋巴瘤
学位
目的:收集PIK3CA基因变异肺癌患者的临床资料,分析其伴随基因变异、临床特征及PD-L1表达,同时对患者生存情况进行随访,进一步了解PIK3CA基因变异肺癌患者临床特征与生存期之间的相关性。方法:选取2017年1月至2020年11月期间在河北医科大学第四医院住院并行基因检测示PIK3CA基因变异的所有肺癌患者。收集符合入排标准患者的临床信息,部分完善PD-L1表达检测,综合其基因突变情况选择最佳
学位
研究背景:HER2阳性乳腺癌是乳腺癌的一种分子分型,占所有乳腺癌的20-25%。目前HER2阳性晚期乳腺癌的标准一线治疗方案为化疗联合抗HER2的大分子靶向治疗,即紫杉类联合曲妥珠单抗和帕妥珠单抗。尽管该治疗方案极大的改善了患者预后,但部分患者因曲妥珠单抗耐药导致复发转移。拉帕替尼和来那替尼均属于小分子酪氨酸酶抑制剂,虽然对于HER2阳性晚期乳腺癌的治疗表现出较好的疗效,但由于价格昂贵或不可及限制
学位
研究背景:腹腔内吻合术(ICA)越来越多地代替传统的腹腔外吻合术(ECA)应用于腹腔镜右半结肠切除术(LRC),已有一些荟萃分析比较了LRC后ICA和ECA的术后并发症,但纳入的大多数是回顾性研究,且没有针对结肠癌患者的分析。目的:本篇荟萃分析通过比较结肠癌患者LRC中行ICA与CEA的术中和术后指标,评估ICA的安全性和有效性,为结肠癌患者LRC选择术中吻合方式提供一定的依据。研究方法:两位研究
学位
目的:食管癌是目前临床上常见的消化道肿瘤,据世界卫生组织公布数据显示,食管癌在全世界的发病率约为7/10万人,死亡率接近6/10万人,食管癌的发病率和死亡率位居全部恶性肿瘤的前十位。我国是食管癌的高发国家,发病人数与死亡人数接近全世界食管癌患者的的50%。我国的食管癌发病率约为22/10万人,死亡率约为17/10万人。我国食管癌患者的发病率和死亡率占我国所有恶性肿瘤的前五位。关于食管癌的发生机制目
学位
目的:程序性死亡-1(Programmed death-1,PD-1)和程序性死亡配体1(Programmed death ligand 1,PD-L1)显著改善了许多患者的癌症治疗。本研究目的为进一步探索肾脏方面的不良反应。方法:我们搜索了Embase,Pub Med和Cochrane图书馆,以确定潜在的合格研究。所有纳入的研究均为随机对照试验(Randomized Controlled Tri
学位