化合物组合诱导中性粒细胞重编程的轨迹分析

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:aixiaowen
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:造血重编程不仅对临床应用有着非常好的前景和重要的意义,其最终目标是可以提供功能性造血干细胞用于血液疾病的治疗,并且提供了不同的维度去理解造血机制。化合物的组合可以诱导已分化的成熟血细胞重编程为造血干祖细胞,这对于今后的临床应用有着巨大的现实意义。CellTagging细胞标记技术是一项新的可以对细胞命运变化进行示踪的技术。单细胞测序技术是近年来发展起来的一项新兴技术,其可以高通量地对细胞的转录组进行测序,基于此特点可以对细胞的异质性有着全面和透彻的研究。将CellTagging细胞标记技术和单细胞测序技术结合可以更好地窥探造血重编程过程中的轨迹变化。方法:首先将小鼠骨髓细胞中的有核细胞感染上细胞标签(CellTag)version 1病毒颗粒,在标记上细胞标签后,对所有细胞进行增殖,将其中一部分细胞作为第一个时间点的标本进行单细胞测序,剩下的细胞被重新置入放有化合物组合成分(VPA,CHIR99021,Repsox)的培养基中,进行造血重编程。将造血重编程细胞作为第二个时间点的标本进行单细胞测序。在两个时间点的单细胞测序数据中,根据8个碱基的随机细胞标签条码,找到细胞之间的对应关系。CellRanger上游分析之后,运用Seurat算法对细胞进行降维聚类,运用Scanpy及PAGA算法对造血重编程进行轨迹分析并对细胞基因表达进行分析。结果:在化合物组合诱导小鼠骨髓细胞重编程之后,运用CellTagging细胞标记技术和单细胞测序技术,发现在所有已分化血细胞中,诱导产生的造血干祖样细胞主要来自于中性粒细胞,并且建立了中性粒细胞造血重编程的轨迹图谱。中性粒细胞造血重编程过程中的诱导细胞类型包括成熟中性粒细胞,非成熟中性粒细胞,中性粒细胞前体,粒单核祖细胞,巨核红系祖细胞,普通髓系祖细胞,造血干祖细胞。其中的轨迹变化路径,可能是一个状态接着一个状态的转变,也可能是跳过某一个或某几个的状态直接转变。Scanpy和PAGA算法对化合物组合诱导中性粒细重编程做出了精准的轨迹图谱分析。结论:VPA联合Repsox及CHIR99021的化合物组合可以诱导中性粒细胞重编程为多能祖细胞,Scanpy及PAGA算法可以通过单细胞测序数据建立中性粒细胞造血重编程的轨迹图谱。
其他文献
近年来,全国税务部门持续推动“放管服”改革,在简政放权、后续管理、优化服务等各方面均取得了明显成效,同时也应看到,我国税收管理在思想观念、管理制度、手段方式等方面仍残存着个别亟待处理的问题,税收营商环境还需要继续优化和提升。在此背景下,税务总局决定从2018年起各省分批试点新办纳税人“套餐式”服务。本文从公共服务创新的角度,通过结合广州市南沙区税务局纳税服务工作开展情况及内外部因素,全面展示新办纳
学位
第一部分:人红细胞CR1与CAA相关脑微出血的关系探索研究目的:补体C3b/C4b受体1(complement C3b/C4b receptor 1,CR1)与脑淀粉样血管病(cerebral amyloid angiopathy,CAA)关系密切。但目前红细胞膜上CR1蛋白与CAA的关系尚无研究报道。本研究旨在探讨红细胞膜上CR1蛋白与CAA的关系。研究方法:自2018年9月到2020年1月,从
学位
2021年是全面开启乡村振兴建设的开局之年,做好乡村振兴对于巩固脱贫攻坚成果和持续全面建成小康社会、关系到我国能否顺利全面建设社会主义现代化强国,而乡村振兴报道是全面展现乡村发展全貌的重要方式。建设性新闻虽然是从国外引进的概念,但在我国新闻实践中有着深厚的土壤,尤其是在乡村振兴报道领域,“建设性”更为凸显。基于此,有必要弄清两者之间的联系,为理解和认知乡村振兴提供一个多角度、立体化的新视角,拓展新
学位
党的第十八届三中全会第一次正式全会提出创新社会经济治理方式新战略命题,党的第十九大政府报告中指出我国要进一步推动整个社会国家治理体系重心逐步下移,作为新型国家基本治理能力体系战略的一项重要内容,其治理核心是人,而最能体现治理核心的地方就是社区。社区作为构成国家治理体系的基石,社区治理在整个社会治理体系构建过程中作为“地基”起着非常重要的作用。党的第十九届六次四中全会上通过的决议~1中首次提出了建设
学位
三农问题是关系国计民生的根本性问题,也是党政工作中的重中之重,而对农电视节目是传播三农信息、解读三农政策、了解社情民意、进行城乡沟通的重要手段和有效途径。在新媒体背景下,传统的以传者为中心的对农电视节目难以满足农民的多元化需求和主动参与欲望,更难以在激烈的市场竞争中打造出差异化优势。对农电视节目的创作与传播应积极应对“新媒体”的挑战,运用“受众导向”策略实现对农电视传播由单方盈利向双方互赢的转变,
学位
随着互联网、移动终端技术的发展,大众的知识内容消费日益碎片化、移动化、视频化。随之一种新的信息载体和信息传播方式——短视频占据了移动互联网的“风口”。经历了爆发式增长,其视频内容也由最初的娱乐为主向内容领域的纵深发展,其中知识类短视频也成为其重要组成部分。短视频与知识传播的话题已经成为学界不可忽视的研究热点。作者在长期短视频的侵染中发现专业性强的财经知识也搭上短视频这辆顺风车,创新知识传播内容形式
学位
随着移动互联网的发展和智能手机的普及,短视频平台已经成为了我国民众喜闻乐见并驻足观看的社交视频类平台。人们在使用手机观看短视频的同时,成为了互联网的“常驻居民”,在线上与他人实时互动和交流。基于短视频平台能够提供相应的电商功能,人们也会在短视频平台上产生一定的消费行为。由于受众对视频内容有着日益精细化的要求,以及人工智能对于视频内容的分发,短视频平台产生了更加细分的垂直类短视频内容。美妆短视频作为
学位
近年来,网络“自嘲文体”在社交媒体平台逐步兴起,不仅展现着当代网络流行现象的全新范式,也体现着网络亚文化群体的精神内核,更折射出新青年群体普遍存在的身份焦虑与价值迷离。针对这一典型网络传播现象,当前学界研究的视角较为单一,相关成果较少。对此,本文从“社会心理学”这一全新视角,对网络“自嘲文体”进行深度剖析,以厘清其背后深层的社会心理,为引导网络社会心理与构建清朗网络环境提供现实参考。基于上述背景,
学位
我国文化类电视节目制作经过以版权引进为主、内容泛娱乐化的探索时期后,逐渐走向关注电视节目原创版权和文化价值的新阶段。近年来,国家政策不断推动媒体融合转型、创建中国特色文化IP,客观上推动文化类电视节目建构IP。基于当前影视制作技术成熟、区域特色文化资源可深度开发的现实情况,文化类电视节目建构原创IP既顺应文化发展潮流,也符合媒体转型需要。“IP”意为知识产权,其与文化资源结合,衍生出“文化IP”的
学位
从2011年至今,我国国家公务员考试报名人数连续12年稳定在100万以上,持续的“公考热”为我国基层政府的执政队伍选拔了大量的青年人才,保障了我国基层治理体系的人力资源。然而,在大量年轻人争相涌入公务员队伍的背后,却有部分年轻干部因多重压力陷入严重的职业倦怠,产生抱怨情绪,有些甚至萌生离职的想法,尤其是在基层的年轻人。本人工作所处的J县,正是我国行政体系中的基层组织,通过平日的工作和同事之间的交流
学位