LncRNA SLC16A1-AS1靶向miR-182/PDCD4轴抑制三阴性乳腺癌进展

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乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤之一,仅次于肺癌,位于癌症相关死亡原因第二位。2018年,乳腺癌导致626679人死亡,占所有癌症相关死亡人数的6.6%。同年,新确诊乳腺癌2088849例,同比占11.6%。随着乳腺癌筛查项目的普及和新型抗癌疗法的发展,乳腺癌的发病率和死亡率已显著下降。然而,中国等发展中国家的乳腺癌筛查率仍然很低。乳腺癌是一组高度异质性的肿瘤,具有不同的发病机制和相对不同的预后。因此,需要不同的临床治疗方案。三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)是乳腺癌的一种分子亚型,由于缺乏激素受体和HER2的表达,与其他亚型相比,TNBC无法从内分泌治疗和HER2靶向治疗中获益。因此,TNBC患者的预后通常最差。对TNBC发病机制的研究揭示了相当多的分子参与了这种疾病的进程,这些分子的功能特征决定其是否能成为抗TNBC疗法的新靶点。长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)不编码蛋白质,但它们调节癌症相关基因表达并参与癌症生物学进程。因此,lncRNA相关的靶向治疗的研究吸引了越来越多研究者的关注。越来越多的证据也表明这些非编码转录本参与了广泛的细胞过程,包括细胞增殖、侵袭、转移、凋亡、分化和免疫反应等,所有这些过程都涉及在肿瘤发生发展过程中。Li等人报道lncRNA HEIH在TNBC中通过miR-4458/SOCS1轴调节细胞增殖和凋亡。此前研究还表明lncRNA GATA3-AS1通过稳定PD-L1蛋白和降解GATA3蛋白促进TNBC进展和免疫逃逸。然而,大多数lncRNAs在肿瘤生物学中的功能仍不清楚。最近的一项研究表明,lncRNA SLC16A1-AS1在肺癌组织中表达下调并成为预后良好的预测因子。我们分析了TCGA数据库,发现lncRNA SLC16A1-AS1在三阴性乳腺癌中的表达也显著下调。由此我们推测lncRNA SLC16A1-AS1很可能参与调节TNBC进程。目的:本研究旨在分析TNBC中lncRNA SLC16A1-AS1参与调节的生物学过程,以及可能的分子机制。研究方法:1、使用GEPIA2(https://gepia2.cancer.pku.cn/#index)数据库分析TCGA数据,预测lncRNA SLC16A1-AS1在TNBC中的差异性表达。使用Reg RNA2和miRanda数据库预测lncRNA SLC16A1-AS1的潜在靶miRNA。使用miRPath DB、miRDB、miRWalk和Target Scan数据库预测miR-182的潜在靶基因。使用Inta RNA2.0(http://rna.informatik.uni-freiburg.de/Inta RNA/Input.jsp)预测lncRNA SLC16A1-AS1/miR-182、miR-182/PDCD4 m RNA可能形成的互补碱基对。2、使用实时荧光定量PCR(Real Time Quantitative Polymerase Chain Reaction,RT-q PCR)法检测lncRNA SLC16A1-AS1、miR-182和PDCD4在术后配对TNBC肿瘤组织/肿瘤旁组织中、裸鼠异种移植肿瘤及TNBC细胞系的表达水平。3、使用RNA荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)法和核浆分离提取RNA实验明确lncRNA SLC16A1-AS1在TNBC细胞中的亚定位。4、使用双荧光素酶活性测定及RNA免疫沉淀(RIP)实验验证lncRNA SLC16A1-AS1/miR-182及miR-182/PDCD4 m RNA的结合力。5、使用Western Blot检测PDCD4在术后配对TNBC肿瘤组织/肿瘤旁组织、裸鼠异种移植肿瘤及TNBC细胞系中的表达;验证lncRNA SLC16A1-AS1、miR-182及PDCD4的相互调节关系;验证lncRNA SLC16A1-AS1对上皮细胞-间充质细胞转化(epithelial-mesenchymal tansition,EMT)的调节作用;验证PDCD4对自噬的调节作用。6、使用流式细胞分析检测lncRNA SLC16A1-AS1、miR-182及PDCD4对TNBC细胞周期进程的影响。7、使用Cell Counting Kit-8(CCK-8)(Dojindo,日本)检测lncRNA SLC16A1-AS1、miR-182、PDCD4对TNBC细胞增殖的影响;检测TNBC细胞对三种化疗药物的IC50值(half maximal inhibitory concentration)。8、集落形成实验检测lncRNA SLC16A1-AS1、miR-182、PDCD4对TNBC细胞增殖的影响。9、使用Transwell(不铺基质胶/铺基质胶)实验检测lncRNA SLC16A1-AS1、miR-182、PDCD4对TNBC细胞迁移和侵袭能力的影响。10、使用免疫组化染色检测PDCD4在术后配对TNBC肿瘤组织/肿瘤旁组织、裸鼠异种移植肿瘤中的表达及Ki67在裸鼠异种移植肿瘤中的表达。11、体内实验(裸鼠异种移植肿瘤模型)验证lncRNA SLC16A1-AS1靶向miR-182/PDCD4轴抑制TNBC增殖。结果:1、LncRNA SLC16A1-AS1在TNBC中表达显著下调,与肿瘤的组织学分级及区域淋巴结转移负相关,与预后良好相关。2、过表达lncRNA SLC16A1-AS1抑制TNBC细胞增殖、迁移、侵袭、EMT,并诱导细胞周期G0/G1期阻滞。3、miR-182是TNBC的促癌基因,lncRNA SLC16A1-AS1充当miR-182的分子海绵,靶向抑制其促癌作用。4、PDCD4是TNBC的抑癌基因,miR-182靶向抑制PDCD4表达,lncRNA SLC16A1-AS1通过竞争性占据PDCD4与miR-182的结合位点,削弱miR-182对PDCD4的抑制作用,进而抑制TNBC进展。5、PDCD4与自噬相关标志物(LC3B及ATG5)存在负向调节关系,可能通过抑制自噬抑制TNBC进展。6、LncRNA SLC16A1-AS1靶向miR-182/PDCD4轴提高TNBC细胞对化疗药物敏感性。7、体内实验(裸鼠异种移植肿瘤模型)证实lncRNA SLC16A1-AS1靶向miR-182/PDCD4轴抑制TNBC增殖。结论:LncRNA SLC16A1-AS1是TNBC的抑癌基因。LncRNA SLC16A1-AS1靶向调节miR-182/PDCD4轴抑制TNBC细胞增殖、迁移、侵袭、诱导细胞周期G0/G1期阻滞、提高其对化疗药物的敏感性。PDCD4可能通过抑制自噬进而抑制TNBC进展。
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