【摘 要】
：
牛肉肉质受脂肪分布与沉积的影响,而脂肪沉积受到复杂且精确的基因调控网络的调节。目前,关于不同部位脂肪沉积的差异调控相关研究主要集中在m RNA水平。本研究为了进一步探究不同部位脂肪的lncRNA表达差异,通过RNA-Seq对秦川肉牛背最长肌、皮下脂肪和肾周脂肪组织的lncRNA表达谱进行了差异分析,探究了差异表达lncRNA可能发挥的功能,并筛选鉴定了对脂肪沉积具有调控作用的lncRNA。主要研究
【基金项目】
：
国家自然科学基金面上项目（编号:No.32172703）；
论文部分内容阅读
牛肉肉质受脂肪分布与沉积的影响,而脂肪沉积受到复杂且精确的基因调控网络的调节。目前,关于不同部位脂肪沉积的差异调控相关研究主要集中在m RNA水平。本研究为了进一步探究不同部位脂肪的lncRNA表达差异,通过RNA-Seq对秦川肉牛背最长肌、皮下脂肪和肾周脂肪组织的lncRNA表达谱进行了差异分析,探究了差异表达lncRNA可能发挥的功能,并筛选鉴定了对脂肪沉积具有调控作用的lncRNA。主要研究内容及结果如下:1.秦川肉牛背肌、皮下脂和肾周脂中lncRNA差异表达分析在秦川肉牛背肌与皮下脂、背肌与肾周脂、皮下脂与肾周脂间分别鉴定出497、565、80个差异表达lncRNA（|log2Fold Change|＞1,P＜0.05）。对差异表达lncRNA的顺式调控靶基因进行预测及功能富集分析,结果显示,背肌与皮下脂和背肌与肾周脂间差异表达lncRNA主要调控免疫反应、肌肉发育和脂代谢相关基因;而皮下脂与肾周脂间差异表达lncRNA的靶基因主要参与物质运输和分泌功能相关生理过程。2.秦川肉牛脂肪沉积相关lncRNA的筛选与鉴定结合RNA-Seq数据中lncRNA表达水平和组织间差异表达情况,选择脂肪组织中高表达的XR＿139735.5、MSTRG.5227.3和MSTRG.26957.2为秦川肉牛脂肪沉积相关候选lncRNA。检测候选lncRNA在24月龄秦川肉牛14个组织部位的表达,结果表明3个候选lncRNA在皮下脂肪组织表达量最高。同时,在牛前体脂肪细胞分化过程表达显著上调（P＜0.05）。采用si RNA干扰候选lncRNA在牛前体脂肪细胞中的表达发现,诱导分化第8天,干扰MSTRG.5227.3的表达极显著抑制牛脂肪细胞脂滴积累（P＜0.01）,表明lncRNA MSTRG.5227.3对牛脂肪沉积具有潜在作用。3.干扰lncRNA MSTRG.5227.3抑制牛前体脂肪细胞分化为了进一步探究lncRNA MSTRG.5227.3对牛前体脂肪细胞分化的影响,利用腺病毒介导的lncRNA MSTRG.5227.3干扰载体在牛肾周前体脂肪细胞中长时间稳定干扰其表达后,诱导分化第8天,细胞内脂滴含量和甘油三酯含量显著下调（P＜0.05）,脂分化主调控基因PPARγ和脂合成基因FABP4、ACCα、FASN、SCD1的表达水平显著下调（P＜0.05）,说明干扰lncRNA MSTRG.5227.3抑制牛前体脂肪细胞分化。本研究通过RNA-Seq鉴定了秦川肉牛背最长肌、皮下脂肪和肾周脂肪组织lncRNA表达差异,并成功筛选到一个新的对脂分化具有促进作用的lncRNA,为从lncRNA水平揭示不同部位脂肪的差异性调控机制提供了一定的参考。
其他文献
繁殖是养猪生产中的关键环节,繁殖力的高低直接影响养猪的经济效益以及生猪产业的发展。卵泡的发育状态在母猪的繁殖过程中发挥着重要的作用,而颗粒细胞作为卵泡中最大的细胞群体,其雌激素的合成,增殖与凋亡等生理功能会影响卵泡的正常发育与闭锁,因此探究影响颗粒细胞生理功能的因素至关重要。MicroRNA（miRNA）是长度约为22个核苷酸的非编码RNA,主要通过与靶基因mRNA的3’UTR配对使mRNA降解或
绒山羊的毛囊具有周期性发育的特征,这个周期性的循环包括生长期、休止期、退行期三个阶段,而毛乳头细胞是毛囊发育的关键信号和组织中心。miRNA对绒山羊毛囊生长发育过程中的相关基因表达具有显著的调控作用。通过对课题组前期绒山羊皮肤组织miRNA测序的结果进行生物信息学分析显示,miR-199a-5p在休止期皮肤组织中的表达量显著高于生长期,并且miR-199a-5p已被报道能够抑制皮肤角质形成细胞、血
绒山羊的被毛由两种不同的毛发组成,短而细的无髓毛和长而粗的有髓毛。无髓毛又名羊绒,由次级毛囊产生,绒的长短、粗细等直接决定羊绒的品质和经济价值。羊绒纤维的形成受多种信号通路、转录因子、角蛋白及其相关蛋白等的影响。转录因子Foxq1是叉头框（Forkhead Box）家族蛋白的一员,参与生物体内DNA修复、胚胎发育和调节代谢平衡等多个生物学过程。本研究结合前期陕北白绒山羊毛囊诱导期和分化期的皮肤组织
骨骼肌是哺乳动物体内最丰富,最复杂的组织,其正常功能的保持对机体健康至关重要,这一过程涉及到多种信号通路及基因的正常运作。作为维持机体运转的重要器官之一,骨骼肌除了与人类生理疾病密切相关,还与家畜产肉量和肉品质息息相关。微小RNA（micro RNA,miRNA）是一组短链非编码RNA,大约由20个核苷酸组成,通过靶向m RNA在转录后控制基因表达,在骨骼肌细胞增殖、分化、肌纤维类型转化及疾病调控
曲细精管内的支持细胞在雄性哺乳动物的精子发生和睾丸发育中起着重要作用。胎儿期支持细胞的增殖是睾丸索形成的基础,而睾丸索又影响着成年期睾丸的正常发育和功能。青春期前支持细胞群的发育程度将决定成年后的生精能力,支持细胞发育或增殖过程中的损害可能导致精子数量和精液质量下降。Micro RNA（miRNA）在精子发生和睾丸发育等过程中发挥重要的调控作用,然而在牛睾丸支持细胞中大多数miRNA的作用机制尚不
以CRISPR/Cas9为代表的各类基因编辑技术是对基因组DNA目标序列或位点的碱基进行修饰的一种基因工程技术。2019年,研究人员在CRISPR/Cas9系统的基础上开发了一种最新的基因编辑工具—引导编辑系统（Prime editing,PE）。该系统将n Cas9蛋白与逆转录酶（ΔM-MLV）进行融合,并在sg RNA的基础上进行改良获得peg RNA（prime editing guide
陕北白绒山羊（SBWC）为主的羊产业是中国西北地区农业经济的主导产业之一,其繁殖性能和生长性能影响着当地山羊养殖业的经济发展,利用分子标记辅助选择（MAS）育种改善山羊经济性状是推动山羊产业高质量发展的有效手段。胰岛素样生长因子2 m RNA结合蛋白（IGF2BPs）家族成员包括:IGF2BP1、IGF2BP2和IGF2BP3,本实验室前期已经证明了IGF2BP1的In Del突变能够影响SBWC
中国云南地形复杂,以山地和高原为主,属热带亚热带气候区。除汉族外,云南还拥有25个少数民族。特殊的地理环境和多样的民族文化形成独具特色的云南黄牛遗传资源。德宏高峰牛和临沧高峰牛统称云南高峰牛,缅甸牛主要分布在与云南德宏、临沧接壤的缅甸东北地区,这3个地方黄牛品种具有耐热与抗病性强等特性。为系统揭示中缅边境地区这3个黄牛品种的基因组遗传多样性和起源进化关系,本研究对22头临沧高峰牛、13头德宏高峰牛
羊奶中含有丰富的短、中链脂肪酸和长链多不饱和脂肪酸,可以满足人体对必需脂肪酸的需求。Micro RNA（miRNA）是一类对有机体多种生命活动都具有调控作用的表观调控因子,可以影响脂肪酸代谢关键基因的表达进而发挥调节脂肪酸代谢的功能。先前研究用过表达方法初步揭示了miR-103对山羊乳腺上皮细胞脂肪酸代谢的影响,但效率较低、作用时效较短。因此,选择先进的研究手段来解析miR-103对于脂代谢的分子
＜正＞学科大概念是指隐含在学科事实性知识本质和规律中的概念和观点，在学生的历史学习和落实核心素养方面意义重大。作为新课程新教材实施国家级示范校，我们在《中外历史纲要（上）》教学过程中，尝试运用大概念实施“教学评一体化”。本文以第四单元“明清中国版图的奠定与面临的挑战”的教学与命题为例，进行说明。