吗啉代寡核苷酸功能化纳米通道生物传感器用于高灵敏检测冠状病毒核酸

来源 :湖北中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangshucai123
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冠状病毒是一类在自然界中广泛存在的传染病病原体,可在脊椎动物间进行跨物种传播,对人畜健康产生严重威胁。由于该类病毒可选择的宿主相对广泛,核酸结构的特殊性,不同病毒间的生存竞争以及病毒在宿主细胞内的快速复制,导致该类病毒不断变异。冠状病毒自1965年在人体被分离出来至今已造成3次重大疫情,其中包括2019年12月下旬爆发的COVID-19,这对全世界的经济和人类的健康产生巨大影响。因此,快速准确地识别致病性冠状病毒对于选择合适的治疗方法,挽救生命和防止疫情的再次爆发具有至关重要作用。随着分子生物学技术的进步,核酸检测方法已成为病毒检测的主导技术。基于逆转录定量PCR(q RT-PCR)的方法具有检测速度快、灵敏度和特异性高的特点,被认为是核酸检测的“金标准”。尽管q RTPCR是一种成熟的技术,但是由于受采样时间不当或采样操作失误等影响,RT-PCR方法可能出现假阴性结果。为阻止病毒的大规模传播,迫切需要一种简单、高灵敏、特异、经济,并且适用于基层大规模筛查冠状病毒检测方法。纳米生物传感器由于灵敏度高、特异性好、分析速度快等优势,在疾病相关分子标志物检测方面得到广泛应用。其中,纳米通道生物传感器已发展为一种具有代表性的纳米传感平台:(一)灵敏度高,由于纳米通道具有纳米级尺寸、高比表面积和纳米级的三维空间结构,即使没有信号放大策略也可实现待测物质的高灵敏检测;(二)纳米通道材料丰富,尺寸大小可控,可根据实验需要设计成不同的构型和孔径大小;(三)表面化学可控,可进行多种官能团化学修饰,对于探针的选择面广。鉴于以上优点,纳米通道是构建生物传感器的良好平台,当前已得到研究人员广泛关注。基于此研究背景,本论文构建了一种吗啉代寡核苷酸(Phosphorodiamidate Morpholino Oligomers,PMO)功能化的纳米通道生物传感器,实现冠状病毒RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)基因的高灵敏检测。由于纳米通道的三维有限空间结构、高比表面积、电中性PMO的背景信号低,提高了探针与靶RNA的杂交效率。通过监测杂交前后纳米通道表面的电荷变化,实现对冠状病毒RdRp基因的高灵敏检测。该传感器免标记、无需信号放大、灵敏度高、特异性好,为大规模筛查提供新的思路。该工作分为以下两个部分:第一章:PMO功能化纳米通道生物传感器的构建在这项工作中,采用聚对苯二甲酸乙二醇酯(Polyethylene terephthalate,PET)作为基底材料来构建纳米通道传感器。首先,通过不对称化学蚀刻的方法制备锥形纳米通道。通过场发射扫描电子显微镜(FE-SEM),观察到制备的纳米通道为锥形且其大口端和小口端的孔径分别为700 nm和44 nm。蚀刻后的纳米通道表面带有大量羧基(-COOH),采用EDC/NHS将氨基化的PMO分子共价连接在纳米通道内。同时采用各种表征,进一步说明PMO功能化纳米通道生物传感器的成功构建,可进行下一步RdRp基因的检测。第二章:PMO功能化的纳米通道生物传感器高灵敏检测冠状病毒RdRp基因本章将该传感器用于缓冲溶液中冠状病毒RdRp基因的检测。首先,考察了该传感器的特异性,结果表明该传感器可以区分靶RNA与其他非互补序列,具有良好的特异性。其次,对其灵敏度进行考察。在一定浓度范围内,靶RNA浓度与电流变化值有良好的线性相关性,而且检测限低至60.7 a M。更重要的是,该传感器可用于咽拭子样本中靶RNA的检测。为了考察该传感器的准确性和重复性,进行了回收率实验,数据显示,该传感器回收效率为81%~123%。最后,将传感器用于临床质控样本的分析,结果表明该传感器可以有效区分阳性和阴性质控样本。综上所述,该传感器在冠状病毒检测方面具有潜在的临床应用价值。
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