侵袭性念珠菌实验室检测方法及分子耐药机制的研究

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第一部分侵袭性念珠菌临床分布情况及耐药分析目的:评估河北医科大学第四医院侵袭性念珠菌病的病原菌分布情况,对比分析各念珠菌药物敏感性差异,筛查唑类药物耐药念珠菌,为侵袭性念珠菌病的流行病学统计提供数据支持。方法:1.收集河北医科大学第四医院2020年1月至2021年6月侵袭性念珠菌病患者临床分离念珠菌126株作为研究对象。2.运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术对菌种进行鉴定。3.采用微量肉汤稀释法检测菌株对9种抗真菌药物的最小抑菌浓度。结果:1.126株念珠菌中,白念珠菌88株,占比70%;光滑念珠菌(14株)、近平滑念珠菌(12株)、热带念珠菌(9株)、克柔念珠菌(3株),各占比11%、10%、7%、2%。2.念珠菌主要分离自血液标本(33株),占26%,腹水(31株),占25%,穿刺液(23株)、胸水(21株)、胆汁(18株)分别占比18%、17%、14%。念珠菌的科室来源以ICU最多(60株),占比48%,其次为外科(35株),占比28%。3.体外抗真菌药物敏感试验显示,热带念珠菌对氟康唑耐药率为30%,对伏立康唑耐药率为11%,其它念珠菌均未检出耐药株。结论:侵袭性念珠菌病病原菌分布情况显示,念珠菌以白念珠菌为主,多分离自血液和腹水,患者多集中在ICU。除热带念珠菌外,其他菌种对抗真菌药物均敏感。而热带念珠菌对氟康唑的耐药率为30%,对伏立康唑耐药率为11%。第二部分1,3-β-D葡聚糖、甘露聚糖IgM/IgG抗体对侵袭性念珠菌病早期诊断的临床价值目的:评估1,3-β-D葡聚糖(BDG)、甘露聚糖IgM抗体(Mn-IgM)、甘露聚糖IgG抗体(Mn-IgG)对侵袭性念珠菌病的诊断价值,对比分析血清学标志物独立及联合检测在诊断性能上的差异。方法:1.收集126例侵袭性念珠菌病患者和104例同期健康体检者的血清作为研究对象。2.采用动态显色法检测BDG,采用ELISA法检测Mn-IgM、Mn-IgG。3.比较分析三项血清学标志物独立及联合检测的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值、约登指数、符合率、Kappa值,绘制ROC曲线并计算其AUC。结果:1.侵袭性念珠菌病患者血清中的BDG、Mn-IgM、Mn-IgG明显高于健康体检人群(P<0.01)。2.BDG的敏感性和特异性为48.41%、92.31%,Kappa值为0.389,AUC为0.842;Mn-IgM的敏感性和特异性为64.29%、91.35%,Kappa值为0.540,AUC为0.829;Mn-IgG的敏感性和特异性为27.78%、95.19%,Kappa值为0.214,AUC为0.737。3.BDG&Mn-IgM的敏感性和特异性分别为76.19%,88.46%,Kappa值为0.637,AUC为0.921;BDG&Mn-IgG的敏感性和特异性为59.52%和91.35%,Kappa值为0.491,AUC为0.856;Mn-IgM&Mn-IgG的敏感性和特异性为69.84%和90.38%,Kappa值为0.588,AUC为0.891。BDG&Mn-IgM&Mn-IgG的敏感性和特异性为80.16%和88.46%,Kappa值为0.679,AUC为0.922。结论:独立检测中Mn-IgM的敏感性高于BDG、Mn-IgG的敏感性,联合检测中BDG&Mn-IgM、BDG&Mn-IgM&Mn-IgG的Kappa值和AUC相对较高,具有较高的准确性。联合多种血清学生物标志物检测的临床诊断价值显著高于独立检测。临床可通过对侵袭性念珠菌病高风险感染患者进行早期多种血清学生物标志物的联合与连续监测,及时调整抗真菌治疗策略。第三部分基于转录组测序探讨热带念珠菌唑类药物耐药机制目的:筛选热带念珠菌对唑类药物的耐药基因,分析热带念珠菌相关耐药机制,为临床合理用药和新药研发提供理论依据。方法:1.将3株唑类耐药热带念珠菌R1、R2、R3作为耐药组,3株唑类敏感热带念珠菌S1、S2、S3作为敏感组进行转录组测序(RNA-Seq)。2.使用DESeq2软件筛选两组之间的差异表达基因(DEGs)。3.运用GO数据库和KEGG数据库对DEGs进行功能和通路的注释与富集分析。结果:1.耐药组和敏感组相比共获得1242个DEGs。其中511个基因表达上调,731个基因表达下调。与耐药相关的ABC转运蛋白基因、MFS超家族转运蛋白基因和麦角甾醇相关基因显著上调,即CDR1、CDR2、CDR3、SNQ2、YCF1、HXT9、QDR3、ERG11。2.根据GO功能分析,上调基因主要富集于药物外排、跨膜转运蛋白活性和膜的组成部分;下调基因主要富集于核糖体生物发生、ATP依赖性RNA解旋酶活性和核仁。3.通过KEGG通路富集分析,上调基因主要富集于缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解、ABC转运蛋白、β-丙氨酸代谢;下调基因主要富集于真核生物中的核糖体生物发生、糖酵解/糖异生、次生代谢物的生物合成。结论:热带念珠菌对唑类的耐药性与外排泵相关的CDR1、CDR2、CDR3、SNQ2、YCF1、HXT9、QDR3基因的表达上调有关,同时麦角甾醇合成相关基因ERG11也有一定程度的过表达。涉及到的功能有药物外排、跨膜转运、核糖体生物发生等,涉及到的通路有物质代谢、ABC转运蛋白等。
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