子痫前期患者胎盘间充质干细胞外泌体miRNAs的初步研究

来源 :大连医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:loveag
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目的:子痫前期(Preeclampsia,PE)是妊娠与血压升高并存的一种疾病,常病情凶险,母亲和胎儿的死亡率很高,这与它缺乏早期诊断措施和有效的治疗方法有关,现在较为公认的理论是,PE作为一种妊娠期特有的疾病,胎盘是此疾病发生发展的中心,胎盘间充质干细胞(Placental mesenchymal stem cells,PMSCs)在帮助我们了解妊娠相关疾病的发病机制和治疗方面具有巨大的潜力,而胎盘间充质干细胞外泌体micro RNAs(Placental mesenchymal stem cell exosomes micro RNAs,PMSCs-Exos mi RNAs)可能是调节胎盘相关生理和病理过程中的重要介质。本实验主要从高通量测序筛选PE患者与正常孕妇的PMSCs-Exos mi RNAs的表达差异入手,对差异表达的mi RNAs(Differentially expressed mi RNAs,DEmi RNAs)进行生物信息学分析,以对PMSCs-Exos mi RNAs在PE机制中的作用进行初步研究。资料与方法:1.重度PE患者为实验组,正常孕妇为对照组,所有进行研究的孕妇均为2019年10月至2020年10月在青岛市市立医院首次接受剖宫产手术的孕妇,所有孕妇的年龄与孕周等同匹配。2.处理手术中得到的胎盘胎膜组织并分离出PMSCs,对PMSCs进行传代培养,光学显微镜观察第三代PMSCs生长形态并用流式细胞仪对细胞表面标志物进行鉴定。3.收集第三代PMSCs的上清液,应用超速离心法分离提取PMSCs-Exos,并用透射电子显微镜技术(TEM)、粒径分析技术(NTA)对分离出的外泌体进行鉴定。4.TRlzol法提取第三代PMSCs-Exos样本的总RNA并对RNA进行质量检测,建立s RNA文库并对文库进行质量检测,使用Rfam、Gt RNAdb、Silva和Repbase数据库对s RNA进行分类,使用DESeq2软件对两组之间的DEmi RNAs进行分析。5.使用mi Randa和Target Scan进行DEmi RNAs的靶基因预测,使用BLAST软件将预测靶基因序列与NR、Swiss-Prot、GO、COG、KEGG、KOG、Pfam及egg NOG数据库比对,联合本课题组PMSCs全长转录组测序结果对靶基因进行GO和KEGG数据库注释和富集分析。6.选择目标DEmi RNAs及其靶基因,在Gene Cards数据库中筛选出与PE相关的基因,取两个基因组之间的交集组,使用Cytoscape软件构建DEmi RNAs与其靶基因的关系网络图。结果:1.实验组与对照组血压(收缩压、舒张压)、24小时尿蛋白、白蛋白、乳酸脱氢酶(LDH)和血清肌酐的差异性在统计学水平而言具有显著意义(P<0.05),而两组间的年龄和体重指数(BMI)及孕周的统计学差异性并无意义(P>0.05)。2.从胎盘组织中获取PMSCs并成功进行传代培养,获得的第三代PMSCs于光学显微镜下呈现出成纤维细胞样外观且形态均一、贴壁生长,特异性表面标志物CD90(99.62%)、CD105(99.99%)经流式细胞学检测皆呈强阳性表达,而造血干细胞标志物CD34(<1%)、CD45(<1%)均不表达。3.从第三代PMSCs的上清液中提取到外泌体,分离提取的外泌体在透射电子显微镜下呈现出杯状结构,平均粒径为70.76nm,浓度为(1.75E+10)Particles/ml。4.使用TRlzol法提取第三代PMSCs-Exos样本的总RNA,质量检测合格后顺利构建s RNA文库,库检合格后使用Illumina Hi Seq2500对文库进行测序,共检测到1,795个mi RNAs,其中已知的mi RNAs共1,254个,541个被预测为新的mi RNAs。5.DESeq2软件分析两组间的DEmi RNAs,共筛选出206个DEmi RNAs,包括35个上调的mi RNAs和171个下调的mi RNAs,预测了16,187个靶基因,联合本课题组PMSCs全长转录组测序结果,发现KEGG数据库中PI3K-Akt signal pathway中PE相关的基因富集程度高。6.从上调的目标DEmi RNAs中选择了1,505个靶基因,在Gene Cards数据库中检索到的1,697个与PE相关基因,并取两个基因组之间的交集组,最终得到与PE相关性最高的120个靶基因,而这些基因大部分受到三种DEmi RNAs的调控,即hsa-mi R-675-5p、hsa-mi R-3614-5p和hsa-mi R-615-5p,据此构建了DEmi RNAs-靶基因网络图。结论:本实验成功地从PMSCs上清液中提取到外泌体,说明了利用胎盘组织来提取间充质干细胞外泌体的可行性,实验结果证明PE患者与正常孕妇PMSCs-Exos在mi RNAs表达上存在差异,联合本课题组PMSCs全长转录组测序结果,发现KEGG数据库中PI3K-Akt signal pathway中PE相关的基因富集程度高,提示PI3K-Akt signal pathway可能与PE发病机制密切相关,根据实验得到的与PE相关性极高的120个基因推测出与PE相关性最高的DEmi RNAs,即hsa-mi R-675-5p、hsa-mi R-3614-5p和hsa-mi R-615-5p,值得进一步研究。
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