PhlG同源蛋白的进化分析和脓肿分枝杆菌中根皮素水解酶MaPhlG的活性鉴定

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lqlq2323
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Pseudomonas fluorescens Pf-5中的PhlG的结构和功能已知,即使是PhlG序列相同性比较高的物种中,PhlG的基因上下文也存在很大差异,这就说明不同物种中的PhlG及同源蛋白很有可能具有不同的功能;我们分析了不同物种中PhlG的进化历程并将不同微生物中PhlG及同源蛋白分为六个不同的功能簇。另外,我们对Mycobacterium abscessus 103和Pseudomonas fluorescens 2P24中的PhlG(文中简写为MaPhlG和PfPhlG)作了正选择分析;在确定了MaPhlG的功能后,我们鉴定了M.abscessus 103中的MaPhlG是基因水平转移的结果。其次,我们鉴定了MaPhlG、PfPhlG和MtPhlG(来源于Mycobacterium tuberculosis中的PhlG)的功能。我们发现MtPhlG有可能是一种全新的合成酶,以根皮素为底物并产生一种新的化合物,可以断裂C-C键的同时形成新的C-C键。PfPhlG的活性实验表明PfPhlG是一种底物特异性很高的DAPG水解酶;PfPhlG中FCA突变成HHI之后保留了DAPG水解酶活性并产生了MAPG水解酶活性,这说明在进化过程中PfPhlG很可能受到了DAPG的选择作用。MaPhlG是一种较为广谱的酶,可以作用于根皮素、DAPG和MAPG,MaPhlG中H160和I162分别突变成F和I之后根皮素和MAPG水解酶活性降低,但是DAPG水解酶活性增高,意味着FCA对DAPG的水解有重要作用,而HHI则对MAPG的水解有重要作用。正选择位点Q266突变为L之后对MAPG和根皮素的活性下降的同时已经失去DAPG活性,这表明Q266和DAPG的活性无关。我们发现PG、根皮酸、肉桂酸对MaPhlG作用于根皮素存在着抑制但抑制作用不明显,意味着MaPhlG对根皮素的活性较低跟产物抑制并没有直接关系。
其他文献
为了更深入研究非调和傅里叶级数,Duffin和Schaeffer在1952年引入Hilbert空间中的框架概念.1986年,框架理论被Daubechies, Grossmann和Meyer等推广与应用.离散框架具有类似基
自然界中,环境对生态系统的干扰是无处不在的,这种干扰方式并不是线性的、不变的,而是随机的,不确定的.因此,随机生物模型能更好地刻画生态系统的实际情况.本文利用随机微分
1998年·Fishburn P提出了κ-等腰集的概念,并在欧氏平面内给出了许多关于κ-等腰集的结论.设P为一平面有限点集,若P的任一κ-元子集(κ≥3)都包含3个点,使得其中一点到其他
本文主要研究了三类不同的反应扩散方程(组)的解的若干性质,包括解的全局存在性、爆破性、爆破时间估计和爆破集合等等.在日常生活以及科学研究中,扩散现象比比皆是,引起众多
本论文以不同年均降水量地区分布的锦鸡儿属植物(Caragana Fabr.)地理替代分布种为材料,以模拟干旱胁迫为手段,研究了锦鸡儿属植物光合特性对逐渐干旱胁迫的响应,及对不同程
超材料是一种亚波长尺寸的周期性结构人工电磁媒介,它具有许多天然材料不具备的电磁特性。近年来,超材料/超表面的研究在通信、图像处理等多个领域引起人们的极大关注。传统意义的超材料是在半导体基底上加工一层(或多层)周期性的金属单元,以此实现对电磁波振幅或相位的调控。但这种普通的超材料不能对电磁波频率进行调谐。近年来,狄拉克半金属超材料的出现为可调谐超材料研发带来了新的机遇。狄拉克半金属拥有石墨烯所具备的
非局部理论的提出是由于经典理论无法用来处理断裂、断层、裂缝等奇异材料和变形材料.最近十几年,非局部模型在非局部扩散、连续介质理论和图像处理等领域得到了迅猛的发展,
随着云计算的快速发展,云数据中心不仅在数量上增加了很多,规模上也产生了迅速扩大,与此同时,能耗方面的问题也日益严重。引入关闭/休眠技术能够较好地解决因计算节点频繁地
目的:本研究归于国家自然科学基金(项目编号:81273703;81804045)。在大鼠受损心肌细胞模型基础上,探索复心汤拆方药对黄芪和葶苈子对线粒体动力学中分裂蛋白及融合蛋白影响,分析线粒体动力学的融合蛋白Mfn1、Mfn2、OPA1与分裂蛋白Fis1、Drp1的表达,评价并判定其干预大鼠心肌细胞的效果。同时随机分组临床试验,观察评定复心汤拆方黄芪葶苈子对心衰患者生活质量、中医证候、Lee氏心衰
土地盐渍化对农业的影响已经引起全社会广泛的关注,植物耐盐机理的研究已经成为了一个热门领域。交替途径是植物体中一个非常重要的呼吸途径,它能够被环境胁迫所诱导,本论文