研究型大学作为国家创新系统的重要组成部分,是基础研究和高科技前沿领域原始性创新的主要来源。由于目前我国企业技术创新能力相对薄弱,以企业为主体的科技创新体系还未建立,研究型大学担负起了科技创新主力军的角色。在研究型大学建设的过程中,国家和地方都投入了大量的资金。论文采用定性分析和定量分析、规范分析和实证分析相结合的方法。首先从国家的政策导向以及它们在我国高等教育事业中举足轻重地位的角度确定了那些入围“985工程”的高校为研究型大学,并全面分析了它们的发展历程、在国家创新体系中的作用和科技创新行为的特性。其次,在分析科技创新绩效评估的必要性和可行性基础上,详细阐述了我国研究型大学科技创新的机理,并构建研究型大学科技创新的理论模型。通过借鉴自组织理论的研究框架,定义研究型大学科技创新过程的系统特征,从系统动力学角度指出研究型大学应该是一个开放式的创新系统,在知识生产和知识转移过程中,外部与政府、企业和科研院所联合创新,内部通过科学研究和科技创新三个子系协同发展,共同推动研究型大学科技创新能力的提升。最后,论文运用DEA方法测度研究型大学的科技创新绩效。在介绍C2R模型、BC2模型、SE-DEA模型以及Malmquist指数等科研绩效测度模型的基础上,将科技创新活动分解为全要素生产率、规模效率和技术效率,从静态和动态两个角度分别对研究型大学科技创新绩效进行分析,结果显示我国研究型大学科技创新绩效整体情况并不理想,其中,技术效率变化指数相对较高,全要素生产率呈现出整体波动性大、各决策单元发展没有规律性的特点,科技创新绩效值理想与否与传统的学校类型和区位没有直接关系。论文进一步探究了导致创新绩效不理想的原因,发现人力资源指标和政府关联度指标对创新绩效有显著的正向影响,区域经济环境指标、产业界关联度指标对创新绩效的影响不显著。在实证分析的基础上,阐述我国研究型大学创新绩效影响因素的作用机理,从经济学角度提出相应的提升策略,在分配机制、科研管理、项目监督、经费来源等方面为国家和地区研究型大学科技创新政策的制定提供参考依据。本文在三个方面做了一些创新性的工作。一是在研究对象的处理方面,从研究型大学的视角来关注科技创新,不但突破了现实创新主体的常规畛域,也使本研究在创新时代的背景中具有一定的时效性;二是在分析科技创新绩效时,既进行了静态分析,又进行了动态分析;三是在指标指标的选择方面,突出了知识生产和知识转移过程中科研投入、创新人才培养和创新技术产出的协同作用,使得对研究型大学科技创新绩效的考察更加科学合理。