基于网络药理学探讨白芍治疗腰椎术后综合征的作用机制

来源 :北京中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xjc132
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目的:在脊柱骨科的临床中白芍常用于镇痛,但对其治疗腰椎术后综合征(FBSS)的机制研究少见。本研究通过网络药理学的方法,探讨白芍治疗腰椎术后综合征的具体作用机制,并为临床用药及拓展适应症提供依据。方法:本研究通过使用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP),查找并获取白芍的化学成分组成,利用口服利用度(OB)大于等于30%和类药性(DL)大于等于0.18作为条件对白芍进行筛选有效成分及成分作用靶点。对于TCMSP中未获取到靶点的成分,先下载其分子模型文件,导入PharmMapper(PM)数据库进行靶点匹配,获得的数据根据结合分数(Norm Fit)大于等于0.9作为条件进行筛选后,将TCMSP数据库和PM数据库获取的靶点,利用Uniport数据库将靶点的蛋白名称与标准基因名(Gene symbol)进行匹配,得到标准的基因名后构建白芍有效成分与作用靶点数据表。借助GeneCard数据库、Disgenet数据库及OMIM数据库收集筛选与腰椎术后综合征有关的疾病靶点信息。利用Venn图获取白芍有效成分治疗FBSS的交集靶点。利用Cytoscape软件,导入数据后分别得到有效成分化合物与成分靶点、有效成分化合物与疾病靶点间的关系网络。用String数据库查找交集靶点间蛋白质互作网络(PPI),用CytoNCA插件对PPI网络进行拓扑学分析,得到白芍治疗腰椎术后综合征的核心靶点。经由Metascape数据库输入白芍与FBSS的交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果:查找得到白芍成分85个,筛选后有效成分13个,其中5个成分未找到靶点,舍弃1个无化学结构文件成分,其余进行补充寻找靶点。利用TCMSP数据库获取白芍的成分及其靶点总计116个,4个补充成分最终筛选出71个相应的靶点。通过与Uniprot数据库比对后,TCMSP和PharmMapper数据库总计获得靶点187个,通过去除重复靶点、舍弃名称不规范靶点、清除非人类靶点后得到125个有效化合物成分靶点。通过GeneCard数据库与Disgenet数据库以及OMIM数据库筛选后纳入FBSS疾病靶点1428个。白芍与FBSS交集靶点43个。由白芍有效成分-作用靶点搭建的互相联系网络中有节点137个,边187条。对其使用网络拓扑学分析、计算得到化合物的度值(Degree)中位数为11。总共有6个化合物高于该中位数。其中山奈酚(kaempferol)度值最高,表明其作用于58个靶点,β-豆甾醇,针对37个靶点排第2。化合物靶点的度值平均数为2.51,高于该度值平均数的被发现有15个。度值较高的基因靶点如孕酮受体(Progesterone receptor,PGR)Degree=5、肽基脯氨酰顺反异构酶 A(Peptidyl-prolyl cis-trans isomeraseA,PPIA)Degree=4、核受体辅激活因子 2(Nuclear receptor coactivator 2,NCOA2)Degree=4、谷胱甘肽 S-转移酶 P(Glutathione S-transferase P,GSTP1)Degree=4。基于获取的String数据库中PPI网络数据,在Cytoscape软件中构建蛋白互作(PPI)网络,其中共30个节点,89条边。根据CytoCNA插件得到的网络拓扑学分析数据,其中度值中位数为5,BC中位数为2.5,CC中位数为0.1439。通过度值大于2倍度值中位同时,大于BC中位数和CC中位数的条件,筛选出其中3个满足条件的靶点作为核心靶点。分别为IL-6、TNF、AKT1。经Metascape数据库查找,得到GO富集信息866条。其中生物过程信息761条,细胞组成信息44条,分子功能信息61条。结果显示与蛋白质同源二聚化活性、蛋白质结构域特异性结合、对激素的反应、管形态发生、细胞迁移的正调控等有关。KEGG通路富集分析富集到通路1 07条。主要涉及癌症途径、脂质与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、神经退行性变的途径——多种疾病、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路。结论:通过数据库获得的结果,白芍含有多种有效成分。白芍治疗腰椎术后综合征是多种成分针对不同靶点共同发挥作用,其中芍药苷、山奈酚是与核心靶点直接相关的成分。利用PPI网络拓扑学分析,白芍的有效成分可以作用于多个腰椎术后综合征靶点,其中白细胞介素6(IL-6)靶点、蛋白激酶B(AKT1)靶点、肿瘤坏死因子(TNF)靶点为白芍治疗腰椎术后综合征的核心靶点。GO富集分析中,生物过程涉及对激素的反应、细胞迁移的正调控、细胞运动的正调控、细胞成分运动的正调控、运动的正向调节、细胞对脂质的反应、平滑肌细胞增殖的调节、凋亡负信号通路的调控、凋亡信号通路的调控、上皮细胞增殖的调控、血管形态发生、平滑肌细胞增殖的正调控、外源性凋亡信号通路的负调控、脂肪细胞分化的调控、肽基丝氨酸磷酸化的调节、血管内皮细胞迁移的调控、脂质代谢过程的正调控、外源性凋亡信号通路的调控、肽基丝氨酸磷酸化的正调控等生物过程。提示以上生物过程可能是白芍治疗腰椎术后综合征的重点生物过程。KEGG通路富集分析后发现白芍治疗FBSS有如下通路:癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、神经退行性变的途径——多种疾病、流体剪切应力与动脉粥样硬化。提示白芍通过这些通路治疗FBSS。结合文献,推测白芍治疗FBSS主要发挥降低糖尿病并发症,降低瘢痕形成,抑制炎性因子等作用,起到抗炎减少瘢痕及组织粘连,控制并发症促进手术切口闭合,镇痛改善生活质量等疗效。
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