哮喘分子标志物BPI、CEACAM8和OLFM4相关性研究及临床意义

来源 :暨南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:leolover211
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:哮喘是一种慢性气道炎症性疾病,其症状的变化取决于各种易感因素和环境因素之间的相互作用。哮喘的诊断和治疗往往是根据症状和肺功能测试结果。近年来对哮喘研究正转向细胞、蛋白质分析、遗传和生物标志物的综合评价。本研究通过分析差异表达基因谱,筛选哮喘相关分子标志物,并在临床病例组织标本中加以验证,筛选出具有一定临床应用潜力的分子标志物。方法:采用全基因组芯片GSE69683比较分析,获得哮喘患者全血中的差异表达基因谱。根据生物信息学分析获得哮喘患者全血中上调表达的基因120个,下调表达的基因130个。接着通过基因本体论(Gene Ontology,GO)的作用和《京都基因与基因组百科全书》(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)途径对筛选出来差异明显基因进行分析。随后构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络找出核心基因团,并对核心基因团再次进行GO分析及KEGG分析,明确核心差异基因的功能作用。接着从这些上调基因中选择3个与哮喘相关的核心基因,即杀菌/通透性增加蛋白(Bactericidal/permeability increas-ing Protein,BPI)、癌胚抗原相关细胞黏附分子8(carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 8,CEACAM 8)、人类嗅素蛋白(Olfactomedin 4,OLFM4),在临床哮喘患者血清标本中通过酶联免疫吸附试验(Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)及统计学分析等方法进一步分析,研究其作为哮喘分子标志物的可能。结果1:生物信息分析结果提示,共有12175对差异表达的基因包含在正常组织与哮喘的对照微阵列中。通过Gene Expression Omnibus 2 R(GEO2R)分析,我们发现上调基因中DEFA4、OLFM4、CEACAM8、LTF、MMP 8、RNASE3、CRISP3、ARG1、LCN2、BPI这10个基因上调表达的差异最明显。下调基因中RPS4Y1、KDM5D、USP9Y、EIFIAY、DDX3Y、TXLNGY、DDX3Y、UTY、EBF1、EIF1AY这10个基因下调表达的差异最明显。通过GO及KEGG分析,上调表达的差异基因生物过程(biological process,BP)主要富集在免疫反应、病原菌防御反应、杀死其他有机体细胞方面。分子的变化功能(molecular function,MF)无主要富集。细胞组分(cellular component,CC)主要富集于胞外区和特异性颗粒。KEGG途径分析显示上调表达的差异基因主要富集于造血细胞系和癌症转录失调方面。下调表达的差异基因BP主要富集于B细胞受体信号通路、B细胞活化的正调控、识别吞噬作用和经典补体激活途径。MF主要富集于质膜外侧面、循环免疫球蛋白复合物和血液微粒。CC主要富集于免疫球蛋白受体结合和抗原结合。KEGG途径分析显示下调表达的差异基因主要富集于细胞受体信号通路方面。我们通过String及Cytoscape分析获得了 6个显著模块。使用DAVID Bioinformatics Resources 6.8分析了最显著的核心基因模块,结果表明核心基因BP主要富集于抗菌体液反应、固有免疫应答、急性期反应和对革兰氏阴性菌的防御反应。MF主要富集于丝氨酸型内肽酶活性。CC主要富集于细胞外间隙、胞外区、胞外外泌体和特异性颗粒。KEGG途径分析显示核心差异基因无主要富集信号通路。结果2:哮喘控制良好组和哮喘控制不佳组的血清BPI水平明显高于健康组。哮喘患者BPI与超敏C-反应蛋白(High sensitive C-reactive protein,hs-CRP)之间仍存在正相关。另一方面,经LD-adjust Bonferroni法校正后,BPI与中性粒细胞之间的相关性不符合显著性标准。BPI、年龄、性别、BMI、过敏史、血液嗜酸性粒细胞、免疫球蛋白E(Immunoglobulin E,IgE)、呼出气一氧化氮(Fractional exhaled nitric oxide,FeNO)或第1秒用力呼气容积占预计值百分比(Pre-bronchodilator forced expiratory volume in one second,FEV1%pred)之间无显著相关性。线性回归分析结果提示,BPI水平与hs-CRP有正相关关系。在血清OLFM4临床研究中,与健康组和哮喘控制良好组相比,哮喘控制不佳组血清OLFM4水平明显升高。与此同时,哮喘控制不佳组的中性粒细胞水平高于健康组。哮喘控制良好组与健康组血清OLFM4水平有差异,但两组之间血中性粒细胞无明显差异。此外,经Bonferroni法进行校正后,血清OLFM4水平与痰中嗜酸性粒细胞呈负相关关系,但无统计学意义。哮喘患者痰液中OLFM 4水平与嗜酸性粒细胞呈正相关关系,具有统计学意义。同时,逐步回归分析结果显示,hs-CRP、中性粒细胞计数与OLFM 4呈正相关关系。哮喘患者血清CEACAM 8水平明显高于健康组。斯皮尔曼相关分析结果显示,血清CEACAM 8水平与年龄、身体质量指数(Body Mass Index,BMI)、过敏史、血嗜酸性粒细胞计数、中性粒细胞计数、FeNO、IgE、hs-CRP、FEV1%pred无相关性。受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic,ROC)曲线分析显示,CEACAM 8水平与哮喘显著相关(ROC 曲线下的面积(Area Under Curve,AUC):0.86,敏感性 74.0%,特异性 86.7%,p<0.0001),截止水平2.92 ng/ml对哮喘的鉴别能力最高。结论:通过生物信息技术分析GSE69683芯片结果提示ARG1、LCN2、CRISP3、LTF、OLFM4、DEFA4、MMP8和BPI是潜在的哮喘相关核心基因。BPI和OLFM4蛋白在哮喘控制不佳患者血清中表达升高,是潜在的哮喘分子标志物。CEACAM8在哮喘患者中表达升高。但仍需更多临床试验明确其临床价值,此外上述3个基因在哮喘中的分子机制也值得进一步探讨。
其他文献
胎盘结构或功能异常是围产期胎儿发病及死亡的重要原因。而滋养细胞是构成胎盘的主要细胞,其侵袭能力与胚胎着床、胎盘形成、胎儿的生长发育以及分娩密切相关。滋养细胞侵袭力异常可导致流产、子痫前期、胎儿生长受限及胎盘植入等疾病。水通道蛋白(Aquaporins,AQPs)是一类对水具有高度选择性的糖蛋白,能够根据渗透压或流体静脉压介导水快速被动地跨生物膜转运。迄今为止,已发现13种水通道蛋白(AQP 0~1
学位
随着互联网的快速发展,市场上很多传统企业逐渐将业务重心从线下转移到线上,本文称之为互联网企业。互联网企业的盛行给传统行业带来了机遇和挑战,传统的运营模式在新的时代下不再完全适用,传统企业之间的关系也在发生变化。企业之间不再是单纯的竞争或者合作关系,更多的是竞争企业之间寻求合作共赢,合作企业之间涉及相同业务而导致相互竞争,因此本文主要研究互联网环境下企业的竞合问题。传统线下企业间竞合策略通常以互补性
学位
目的:研究糖尿病足相关炎症因子对间充质干细胞外泌体的影响及外泌体对血管生成的调控机制,探讨干细胞外泌体和血管成形术的联合应用在糖尿病足炎症环境中改善循环的作用。方法:⑴将间充质干细胞置于相关炎症因子(VCAM1、TNFα、IL6)中培养,提取外泌体并观察其形态及浓度,通过BGISEQ-500技术检测其mi RNA差异性表达。⑵将炎症因子刺激后产生的干细胞外泌体与血管内皮细胞共孵育,通过荧光共聚焦、
学位
【目的】观察术前30min静脉泵注右美托咪定联合帕瑞昔布钠对功能性鼻内镜手术患者围术期镇静、抗焦虑效果,对气管插管血流动力学和应激反应以及术后恢复质量的影响,以期找到一种安全、舒适、有效的麻醉用药方案,为功能性鼻内镜手术的围术期麻醉管理提供相关理论依据。【方法】试验研究过程分为三个部分进行。(1)术前右美托咪定联合帕瑞昔布钠用于功能性鼻内镜手术患者术前镇静和抗焦虑情绪的影响。择期行功能性鼻内镜手术
学位
B2C模式下商品退货现象越来越普遍,退货的回收处理问题对供应链系统运作效率,快速响应能力以及物流资源合理配置提出了更高的要求,高效稳健的闭环供应链网络设计成为企业管理者必须要思考的问题。设施选址与库存控制作为供应链网络设计不同层面的重要决策,对其进行集成优化可实现加快供应链效率,降低企业运营成本,提高物流服务水平的目的,从而避免其陷入局部最优。因此,研究B2C模式下考虑退货的闭环选址-库存集成优化
学位
互联网技术的迅猛发展和通信基础设施建设的普及和成熟,促使越来越多的制造商和零售商直接参与电子商务经营活动,极大地推动了电子商务产业的繁荣和发展。电商平台企业和零售商需要对参与电子商务零售经营的渠道结构建设、批发价格、零售价格和电商平台的准入门槛等系列问题进行科学权衡;对制造商来说,积极参与线上零售布局,扩大线上线下零售渠道,成为制造商追求可持续发展的重要商业战略决策。本论文通过对自营电商开放平台上
学位
第一部分基于CT影像组学模型鉴别亚实性肺结节微小浸润性腺癌与浸润性腺癌目标:探讨基于CT影像组学模型在亚实性肺结节(SSN)微小浸润性腺癌(MIA)与浸润性腺癌(IAC)的预测诊断价值。材料和方法:回顾性收集手术根治切除并病理组织学确诊的亚实性肺腺癌患者190例,其中MIA组81例(男,25例;女,56例),IAC组109例(男,42例;女,67例)。所有患者均在术前一个月内接受胸部CT检查。阅读
学位
【背景及目的】大量研究表明耳鸣患者静息态大脑出现活动异常,但少见既往静息态功能磁共振耳鸣研究就单一暴露因素的耳鸣进行观察。此外,使用种子点功能连接(Functional Connectivity,FC)的方法观察耳鸣对听觉网络(Central Auditory System,CAS)和非听觉网络(None-CAS,NAS)影响时,种子点的确立应既是耳鸣症状相关的功能解剖脑区,又应是与耳鸣临床评价特
学位
背景和目的甲基乙二醛(methylglyoxal,MG)是糖酵解途径产生的主要副产物[1],在高血糖中血液含量明显增加,导致血管内皮功能障碍和促进血管并发症的发生和发展[2]。蛋白质与葡萄糖发生非酶促反应形成糖苷键的过程被称为糖基化作用。MG是一种高反应性的羰基化合物,其通过与蛋白质或脂类物质发生非酶促糖基化反应生成晚期糖基化终末产物(advanced glycation end products
学位
第一部分结直肠癌组织中miR-506的表达及临床病理意义目的:研究结直肠癌组织的miR-506表达水平,并研究结直肠癌耐药细胞中miR-506表达水平,探讨miR-506与结直肠癌临床病理相关性。方法:收集了49例结直肠癌和相应的癌旁组织,采用荧光检测法(q RT-PCR)对miR-506表达进行检测,并利用卡方检验对肿瘤组织样本中miR-506的表达量与病理参数之间的相关性进行分析。用梯度药物法
学位